RNA结合蛋白Sam68内在无序区域的结构与动力学研究
项目293 · University of Leicester · Molecular and Cell Biology
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项目介绍
【项目介绍】 人类蛋白质组中有很大一部分由非结构化区域组成,这些区域被称为内在无序区域。近年来,研究表明这些区域对几乎所有细胞功能都至关重要,但关于这些IDRs功能的分子机制的结构研究在很大程度上仍属未知。
一个典型的例子是致癌RNA结合蛋白Sam68,这是一种多功能蛋白,参与RNA代谢调节和信号转导,在多种癌症中常过度表达。虽然Sam68中央RNA结合域在RNA识别中的作用已被充分表征,但目前尚不清楚Sam68 N端和C端IDRs如何参与RNA结合和蛋白质功能,尽管这些区域受到多种翻译后修饰的调控,这些修饰调节Sam68的功能。通过研究PTMs在调节Sam68细胞功能中的作用,我们已证明Sam68 N端和C端IDRs特异性结合RNA,且这些区域被Cdk1磷酸化会调节其RNA结合和蛋白质的细胞功能。这些区域如何特异性结合RNA以及单个氨基酸的磷酸化如何影响相互作用仍不清楚。我们的假设是Sam68的IDRs采用对特异性RNA识别至关重要的瞬时结构特征,这些区域的磷酸化调节这些特征,阻止RNA结合。我们的假设得到了强有力的初步NMR数据支持。
我们将结合多种生化、生物物理和结构技术来解析Sam68 IDRs在游离状态、与RNA复合或被CDK1磷酸化后的结构特性。这项多学科项目将为IDPs/IDRs的RNA结合特性提供独特的结构和机制见解。
【研究技术】 • 蛋白质表达(E. coli)和纯化 • 核磁共振(NMR) • 荧光相关光谱(FCS) • 单分子Förster共振能量转移 • 小角X射线散射(SAXS) • 分子动力学模拟
【联系方式】 项目咨询邮箱:cd180@le.ac.uk
【申请方式】 请使用本网页底部的申请链接进行申请 University of Leicester | 分子与细胞生物学 | 研究生研究
【资金信息】 本项目仅接受自费申请或拥有个人资助的申请者。
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