地下水微生物与病毒生态及环境生物信息学博士

项目2432 · ETH Zurich · Department of Earth and Planetary Sciences

所在国家或地区: 瑞士
申请截止日期: 2026-11-30（具体时刻请核对原始公告）
资助信息: 100%全职固定期限职位，完整资助48个月；具体工资档位及2027金额未列。

申请工作台

保存项目，围绕当前机会准备申请。截止日期和资格请以原始公告为准。

项目介绍

项目概览

苏黎世联邦理工学院（ETH Zurich）地球与行星科学系温室气体地学减缓研究组招收地下水微生物与病毒生态、环境生物信息学博士。苏黎世100%全职固定期限职位，明确完整资助48个月，预计2027年3月1日开始。项目属于新获瑞士国家科学基金会（SNSF）资助的跨学科研究，2026年11月30日截止。

项目详情

地下水是全球碳循环中重要而尚未充分理解的一部分。水岩相互作用影响地下水化学，微生物通过代谢转化碳，病毒与宿主的生态关系也可能影响这些过程。不同水龄和地球化学条件下，群落如何响应，以及这些关系怎样影响地下碳的去向，仍是未解决的问题。这里研究环境生态与生物地球化学，而非疾病传播或临床病毒学。

博士研究将围绕地下水水龄梯度，考察微生物与病毒多样性、代谢活动和演化适应，将环境宏基因组、宏转录组、病毒宏基因组与水文地球化学测量结合，理解地下碳循环中的生物过程。重点不只是列出样本中有哪些生物，还要连接环境条件、群落及功能。

具体工作包括分析大型环境测序数据，研究群落多样性、活动及功能；描述微生物的代谢潜力和活动，重点关注碳循环相关途径及环境响应；考察跨水龄和地球化学梯度的群落变化、宿主关联及演化适应；整合多组学与水化学数据，解释地下生物过程与碳循环的关系。这是研究任务概观，具体分析方案和判断标准将由课题组制定。

岗位也包含环境样本DNA及RNA提取，以及支持性的实验室分析，包括流式细胞术、显微镜相关的细胞丰度与活动测量。它并非完全无实验的远程计算职位，也未要求申请者入学前掌握所有实验技术。这里保留训练类别，不提供样本处理操作、感染培养或病毒改造方案。

学生须把成果写成科学论文，在国际会议和工作坊报告，并与主要研究者、科学合作伙伴、另一名负责地下水水文地球化学的博士生及其他组员合作。团队强调支持性环境与开放沟通，具体伙伴姓名、样本来源、数据成熟度及论文数量没有公布。

申请要点

申请者须有微生物学、微生物生态、生物信息学、计算生物学、地球生物学或相关硕士学位；已有宏基因组分析或相近环境生物信息学实践；能在Linux／Unix命令行环境工作、熟悉计算生物学流程；至少会Python、R或Bash等一种编程或脚本语言。还需要微生物生态、生理和／或代谢的扎实理解，复杂数据分析与解决问题能力，创造力、主动性、独立与协作能力，以及优秀英语口头和书面表达。

基因组解析宏基因组、宏转录组、比较基因组或高性能计算经验特别有利；环境DNA／RNA提取经历受欢迎。地下水微生物、环境地球化学或生物地球化学背景有帮助，但原文明说不是必需。不能把优先经历与前述核心条件混为一谈。

仅在线申请，提交最多两页动机及研究兴趣求职信、最多两页CV、本科和硕士成绩单、硕士学位证电子版，以及两位学术推荐人的联系方式；不需要推荐信。邮箱或邮寄申请不被接受。团队预计截止后两至三周联系申请者。咨询Prof. Nicole Fernandez-Franzan，nicole.fernandez@eaps.ethz.ch，此邮箱不收申请。

需要进一步确认

岗位承诺直接PI指导，由科学伙伴提供环境生物信息学、微生物与病毒生态专业指导；可参与助教、博士课程、可迁移技能训练，使用大型多组学数据及ETH计算资源。灵活工作安排须符合实验室和项目职责。薪资档位、2027工资、具体数据／计算支持、指导分工和研究费用未公布。48个月资助和预计开始时间已明确，不应写成未知；个人学历、注册及居留仍需审核。

岗位还介绍公共交通季票及共享汽车、ASVZ体育活动、儿童照护及养老金等雇佣福利，具体适用及费用依学校制度。团队强调尊重与包容，重视高质量研究、开放讨论及创造性思考，学生可在广泛院系专长中开展跨学科交流。

查看收录来源与申请要求

收录来源可能是学校或招聘平台；正式申请入口及最新要求请核对公告与下方报告中的官方来源。

项目深度调研报告

报告生成记录：2026-10-28。生成日期不代表招聘方确认项目仍开放。

资料更新记录：2026-10-28。申请前请再次核对原始公告。

ETH地下水生态博士研究报告：连接水龄、环境群落与碳循环

项目判断

这个博士研究地下水微生物与病毒群落怎样随水龄和地球化学条件变化，以及这些差异对地下碳循环意味着什么。工作把环境多组学、水文地球化学及支持性实验测量结合，最需要的是已有环境宏基因组、Linux与脚本分析经验，并希望加强环境机制解释的相关硕士背景。

官方岗位明确为苏黎世100%全职、完整资助48个月，预计2027年3月1日开始，2026年11月30日截止。首先需要确认样本与数据是否已准备好、未具名科学伙伴的身份及指导投入，以及个人ETH录取和安全审查条件。官方岗位。

研究问题与博士工作

地下水化学同时受到水岩反应与生物转化影响。项目希望理解，沿水龄和地球化学梯度，微生物多样性、活动、代谢和演化适应如何变化，病毒及宿主的生态关系又怎样参与其中。研究要把环境群落变化与地下碳的去向连接起来，产出能够解释过程的证据。

广告任务包括大型环境宏基因组、宏转录组和病毒测序数据分析，碳循环相关代谢潜力与活动研究，群落和宿主关联分析，以及多组学与水文地球化学测量整合。岗位也包含环境DNA／RNA工作及流式细胞术、显微镜相关的细胞丰度和活动测量，因此不是完全无实验的计算职位。

分析中必须分清三种结论：遗传信息显示的代谢潜力、活动证据，以及实际碳转化速率。不同测量相互一致可以增强解释，却不能自动互相替代。水龄梯度也并非只有时间变化，流动路径与水化学可能同时改变。USGS说明，井水或排泄点样本可能混合不同流路、不同停留时间的水。因此，不能未经论证就把水龄估计当作严格排序的生物时钟。这些是分析时应考虑的问题，不是新增工作包或既定数据分析流程。USGS水龄解释。

学生将与PI、科学伙伴、另一位负责地下水水文地球化学的博士生及其他组员合作，写论文并在国际会议／工作坊交流。合理的博士产出方向，是把可复核的环境数据解释与地球化学约束结合。现场地点、样本数量、采样责任、数据就绪程度、生物学确认及论文目标尚未公布，应问清两位博士如何共享元数据和阶段任务。

学校、学科与培养

雇佣与学位机构均为ETH Zurich，依托地球与行星科学系（D-EAPS）地质研究所。新设温室气体地学减缓研究组关注水岩反应、化学与同位素示踪、地下水停留及碳动态。学科吸引力是把环境生物信息学与定量地球化学连接起来，未见与项目伙伴联合授予学位的证据。研究组。

ETH在2026年3月官方说明中确认，QS学科排名地球与海洋科学、地质学、地球物理学均第一，环境科学第四；QS学校现行资料的综合并列第八属于2027年。年份和范围不同，均不能当作新研究组的指导质量排名。2026学科说明、QS学校资料。

D-EAPS现行文件入口仍链接标题为旧系名D-ERDW的规则，规定暂定录取后9—12个月进行资格考核，提前提交博士计划，并安排第二指导人和个人课程计划。ETH适用于2022年后入学者的规则要求至少12 ECTS，包括至少1学分伦理／良好科研实践，并按院系规定认可课程。教学和其他职责应写进博士计划。四年资助属于雇佣承诺，不保证自动通过学术阶段考核。院系规则、博士课程、博士计划。

导师、合作伙伴与近期论文

Nicole Fernandez-Franzan于2025年12月以预聘助理教授身份加入ETH。官方介绍聚焦低温地球化学和水岩相互作用，使用实验、同位素工具及反应输运建模，构成明确的水文地球化学基础。岗位承诺由一位科学伙伴提供环境生物信息学、微生物及病毒生态专业指导，但未具名。应确认其身份、时间投入和计算指导分工，不能仅凭PI地球化学头衔推定全部微生物专业支持已明确。导师资料。

三篇近年导师论文说明研究方法上的基础：

Rembert等2025年《Advances in Water Resources》将反应输运、地球物理模型与方解石溶解实验连接，解释反应的时空分布；Fernandez参与方法、软件和概念构建。它支持用机制模型整合不同观测，不是微生物或病毒机制的验证。出版方摘要。
Fernandez等2024年《Communications Earth & Environment》研究纽约流域野火烟雾事件与溪流磷变化，降雨影响响应时机；导师负责主要设计、分析与写作。启发是化学信号需要放在事件环境中解释，但该地表水研究不能证明本项目地下水群落中的因果关系。论文。
Fernandez等2022年《JGR Biogeosciences》综合水流停留时间分布与多种分馏途径，解释六条溪流各具特点的硅输出。贡献是分开场地结构和反应过程的影响，而非只看浓度，适合思考梯度解释；它并非直接的病毒宿主研究。论文。

本次读取一手完整摘要及部分背景、作者贡献；部分出版页直连失败时使用其已索引正文，未声称逐字读完全文或重分析数据。评估时应同时考虑新ETH研究组、项目伙伴及院系环境；既往Cornell工作不代表原设施已移至ETH，也不构成ETH博士毕业去向证据。

资助、苏黎世成本与国际申请条件

岗位明确提供48个月资助及ETH计算资源，但工资档位和2027金额未列。仅作参考，ETH 2026年100%第一年标准档税前年薪CHF53,500，另有更高档位，实际以合同为准。估算可支配收入前，还须考虑税、养老金／社会扣缴和医疗保险。工资规则。

ETH博士财务说明列出外校毕业生注册费CHF150、考试注册时的一次性博士学费CHF1,500及学期必缴费用，未见本岗位另行豁免。苏黎世欢迎指引提醒，不奢侈的生活也可能花到每月CHF2,000；它不是2027雇员预算，不能用税前年薪减这一数字预测结余。接受前应核对实际房租、押金、保险、移民及抵达费用。博士费用、苏黎世生活。

ETH通常要求符合资格的大学硕士及接收教授，博士注册前所有硕士工作须完成并有成绩。岗位申请与之后的注册是不同程序；中国原件须按学校要求附认可翻译及文件，具体学历由校方认定。广告要求优秀英语，但未公布通用雅思门槛。录取要求、注册文件。

2026年10月现行安全审查考察既往院校、国家／背景、资金及研究技术。中国在国家名单中，非穷尽的来源院校名单也包括中国大学。10月5日博士说明建议，多项审查条件为肯定时拒绝，同时保留由教授提出深入审查的路径。它不等于国籍一刀切禁止，也不是本项目已获放行；环境研究标题本身不能确定分类。申请者须按自身情况核实，不能宣传为中国申请者无条件可申。审查入口、博士说明、国家名单、来源院校。

申请准备与职业价值

核心条件为相关硕士、已有宏基因组／环境生物信息学实践、Linux／Unix、一种编程或脚本语言、微生物基础、分析及独立协作能力和优秀英语。基因组解析、宏转录组、比较基因组、HPC和环境DNA／RNA经历属于优势；地下水或地球化学经验有帮助，但明确不是必需。可用一个已完成的环境数据项目，说明元数据局限、测量能支持及不能支持的结论，这是准备建议，不是新增门槛。

环境数据整合、复现、跨学科解释及交流能力，可迁移到学术生态、环境评价和水研究。美国劳工统计局资料说明环境科研中的数据、报告、咨询与政府工作，许多岗位本科即可进入；它用于理解技能用途，不代表瑞士／中国岗位需求、博士薪酬溢价或本组就业率。职业结构。

下一步与待确认问题

仅在线申请，2026年11月30日截止。提交最多两页动机／研究兴趣信、最多两页CV、本科和硕士成绩单、硕士学位证电子版，以及两位学术推荐人联系方式，不需要推荐信。预计2027年3月1日开始，团队称截止后两至三周联系。nicole.fernandez@eaps.ethz.ch只接受咨询，不收申请；未列具体截止钟点和时区。

申请前核对硕士完成、文件与个人录取／安全审查时间。面试时问清科学伙伴、数据样本就绪程度、水龄／地球化学不确定性、与另一位博士的协作、计算支持及实验分析比例。接受前取得工资档位、四年承诺内合同及续签安排、教学分配、研究／现场费用和许可进度的书面说明。这些答复能帮助判断，四年资助是否足以支撑课题所需的跨学科合作。

证据与来源

截至2026年10月28日，已核实官方当前招聘及在线申请入口仍有效；提交前请复核截止日期与申请入口。

项目、团队与科研

学校与博士培养

录取与安全审查

财务与职业

按研究方向和所在国家或地区整理，优先展示资助类型相近的机会。申请前请核对各项目的最新公告。

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2026-12-01（具体时刻请核对原始公告）

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招聘明确为全额资助博士，合同为临时性质；2026 年 9 月 9 日已核验的 ETH 官方招聘明确 100% 全职。具体合同年限及本岗位工资金额仍未明确。

滚动申请，当前是否仍招请核对原始公告。

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Horizon Europe–ERC Starting Grant GI-CORONA，参考号101302803。采集的项目说明未给个人工资与合同年限，需核实正式岗位条件。