真核生物中转录与翻译的偶联研究

【项目介绍】 基因表达传统上被描述为一个线性过程，转录和RNA加工发生在细胞核内，而翻译则局限于细胞质中。然而，新出现的证据对这一观点提出了挑战，表明翻译相关过程可能发生在细胞核内。

本博士项目将研究转录和翻译如何在功能上偶联，旨在重新审视mRNA监控的概念。我们假设，核糖体扫描新生转录本并非仅作为降解途径发挥作用，而是作为一种筛选机制来识别有效的蛋白质编码mRNA，从而在细胞核内参与mRNA的定义过程。

该研究基于Saverio Brogna实验室的研究成果，包括证明RNA监控因子（如UPF1）与转录本共转录结合并调节mRNA从基因位点的释放的研究。

关键科学问题包括：

• 转录和翻译如何在机制上偶联？
• 核糖体是否在细胞核内扫描新生转录本？
• 翻译相关过程能否区分有效mRNA和非有效RNA种类？

本项目将使用粟酒裂殖酵母（Schizosaccharomyces pombe）和黑腹果蝇（Drosophila melanogaster）作为研究系统。这些互补的系统使得能够在进化上相距较远的真核生物中探讨同一基础问题，确保研究发现反映基因表达的保守原则。

本项目结合分子遗传学、RNA生物学和计算分析，提供CRISPR-Cas9基因组编辑、RNA纯化和RNA-seq以及转录组数据生物信息学分析方面的培训。

成功入选的候选人将加入一个专注于RNA生物学基础机制的研究环境，该研究在真核生物中具有广泛的相关性，并对基因调控和疾病研究具有重要意义。

【申请要求】 鼓励具有分子生物学、遗传学、生物信息学或计算生物学背景的申请者申请。项目将提供全面培训。

【资助信息】 本博士项目仅接受自费申请者。申请者必须在申请前获得外部资助（如国家奖学金、政府资助或国际奖学金）。

【参考文献】 Brogna, S., Sato, T.A. & Rosbash, M. (2002) Molecular Cell Singh, A. et al. (2019) eLife 8: e41444 Recent work: Nucleic Acids Research (PMID: 34928380)