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AI × 生态博士|追踪野生动物与环境之间可能的病原体传播路径

项目2543 · University of Exeter · Centre for Ecology and Conservation (CEC).

申请工作台

保存项目,围绕当前机会准备申请。截止日期和资格请以原始公告为准。

所在国家或地区
英国
申请截止日期
2026-12-08(具体时刻请核对原始公告)
资助信息
合资格的 2027 EPSRC DLA 全日制获奖者可获最长 3.5 年资助,包含全额学费、以 2026/27 年度 £21,805/年为基准的生活津贴及总额 £5,000 的研究培训支持经费;2027/28 津贴尚未公布。国际生全额奖学金名额不超过 cohort 的 30%,成功获奖者学费差额由学校承担。学生签证、医疗附加费和赴英搬迁费用由申请人自行承担。野外采样、交通和异地住宿预算未明确。

项目介绍

项目概览

本项目把野生动物及环境样本的宏基因组信息,与宿主移动、栖息地和环境条件结合,再用机器学习和网络分析估计病原体的出现、持续和传播路径。项目列出随机森林、梯度提升、深度神经网络和 MOFA。申请要求项目特定的量化学科硕士背景;样本覆盖、病原活性确认和跨时空验证设计仍需询问。

项目详情

研究首先使用高通量宏基因组测序,刻画代表性野生动物种群及其环境中的微生物与病原体多样性。项目 PDF 将迁徙鸟类和獾列为研究系统示例,并提及水、土壤、沉积物和动物觅食栖息地等环境样本;具体物种、病原体、地点、样本数量和测序平台尚未列明。

第二步将微生物群落组成与宿主特征、移动行为、栖息地利用、季节性和环境条件关联,寻找生态驱动因素及候选传播路径。第三步将对数据进行预处理、特征工程和特征选择,并建立预测病原体出现、持续或景观尺度扩散的机器学习流程。项目点名随机森林(Random Forest)、梯度提升机(Gradient Boosting Machine)和深度神经网络;还计划用 MOFA 分析不同组学/环境数据间的协变关系,并用网络分析识别可能的传播路径。

项目目标是产生可支持监测、管理和防范的基础知识与分析框架,但不保证获得特定干预或公共卫生结果。宏基因组检测、协变关系或网络连接本身不能证明病原体具有活性、宿主可以传染或传播方向成立;样本匹配、阴性对照、确认性检测和时空外部验证都会影响推断强度。

研究团队包括主要导师 Xav Harrison、Stuart Bearhop、Barbara Tschirren,以及英国动物与植物卫生署(APHA)合作者 Ruth Cox。团队背景覆盖动物微生物组、病原体与宿主健康、动物迁徙和觅食生态、疾病与寄生虫生态及野生动物疾病实践。具体指导分工、APHA 的项目级参与方式、数据访问权限和野外采样安排尚未明确。

申请要点

  • 项目专属学历条件:硕士学位须属于量化学科,项目文件列出数学、计算机科学和统计学。等同专业和课程背景需向项目组确认。EPSRC DLA 通用学术条件另作适用,不能以项目专属硕士条件取代。

  • 研究将使用随机森林、梯度提升、深度神经网络、MOFA 和网络分析;项目未将精通每种方法或既往野外经验列为额外硬性门槛。编程、数据预处理、模型验证及生态数据分析经历有助于说明准备程度。

  • EPSRC DLA 全日制资助最长 3.5 年;成功且符合条件的获奖者可获全额学费、2026/27 年度 £21,805/年生活津贴基准及总额 £5,000 研究培训支持经费。2027/28 津贴尚未公布;RTSG 是研究支持经费,不是个人生活津贴。

  • 全国 DLA 页面说明,成功获得埃克塞特国际生奖学金的学生无需自行补缴 UKRI 与国际学费差额;国际生最多占 cohort 的 30%,获得奖项仍属竞争性选拔。签证费、移民医疗附加费和搬迁费不由此项资助覆盖。

  • 中央 EPSRC DLA 页面列出 2026 年 12 月 8 日星期二中午 12 时申请截止,推荐信须于 2027 年 2 月 15 日前提交;One Health 项目 PDF 未列单独的推荐信日期。中央页面概览预计 2027 年 2 月 15–24 日面试,但申请流程段仍残留 2026 年面试和结果日期。申请通常包括个人陈述、简历、成绩单、两封推荐信及需要时的英语成绩证明;请确认 One Health 项目的实际申请链接和面试时间表。

  • 生活成本:埃克塞特对 Exeter/Cornwall 单人每月基本开支估算为 £1,300–£2,000;当前津贴月均约 £1,817。Penryn 2026/27 年宿舍例价约 £149.66–£199.50/周;房源与未来租金不保证。政府学生签证的 £1,171/月财力门槛是移民证明标准,不代表实际生活预算。

需要进一步确认

需确认申请者具体硕士学位是否符合量化学科条件、正确项目申请链接、物种与病原体范围、环境样本和野外点位、已获取样本及数据权限、测序与确认性检测方案、模型基线和时空外部验证、APHA 与各导师的分工、正式 Biological Sciences 注册路径、3.5 年资助覆盖、国际生奖项名额及野外工作和交通预算。

项目深度调研报告

报告生成记录:。生成日期不代表招聘方确认项目仍开放。

资料更新记录:。申请前请再次核对原始公告。

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AI × 生态博士|追踪野生动物与环境之间可能的病原体传播路径

资料核对日期:2026 年 11 月 3 日

快速判断

项目将野生动物及环境样本的宏基因组信息,与宿主移动、栖息地和环境条件结合,再用机器学习与网络方法估计病原体的出现、持续和传播。项目列出随机森林、梯度提升机、深度神经网络和 MOFA。课题适合具有项目所要求的量化学科硕士背景、并关注野生动物疾病生态的申请者。样本覆盖、病原体活性确认以及跨地点或季节的验证设计,仍是关键待核实问题。

研究问题与博士工作

尚待解决的问题及其意义

病原体可以在野生动物宿主与其所处环境之间传播,但传播路径及其持续条件往往难以直接观测。本项目拟结合宏基因组证据,以及宿主特征、移动、栖息地利用、季节性和环境条件等信息,研究如何识别病原体在哪里出现、如何持续存在并在景观中扩散,以及哪些生态因素与这些模式相关。

项目希望为更有针对性的监测和管理提供依据,但宏基因组检测本身不能证明病原体仍具活性、宿主具有传染性或传播方向。数据协变或网络中的一条边同样只是候选传播路径,而非已证实的传播事件。研究结论的可信度将取决于样本是否匹配、阴性对照是否充分、是否有确认性检测,以及模型能否在不同时间、地点或宿主群体中验证。公开项目说明尚未给出这些设计细节。

项目公布的研究任务与方法

项目 PDF 列出三个衔接目标:

  1. 刻画微生物和病原体多样性。 在代表性野生动物种群及其相关环境中开展高通量宏基因组测序,环境样本包括水、土壤、沉积物和动物觅食栖息地。
  2. 把微生物模式与生态因素联系起来。 将微生物群落组成与宿主特征、移动行为、栖息地利用、季节变化及环境条件相结合,寻找可能影响传播的生态因素。
  3. 建立预测分析流程。 对测序及环境数据进行预处理、特征工程和模型/特征选择。项目点名随机森林、梯度提升机和深度神经网络,用于预测病原体出现或传播风险;使用 MOFA 识别不同数据类型的协变关系,并通过网络分析寻找可能的传播路径。

拟研究的目标包括病原体出现、持续存在和景观尺度传播。项目说明以迁徙鸟类和獾为野生动物系统示例,但没有公布完整或已确定的采样对象。预期研究可以为监测、管理和防范提供知识基础;这些属于潜在用途,不是保证实现的成果。项目 PDF 未说明病原体类别、样本量、采样地点、测序平台、对照设置、诊断确认方法、数据归属或训练/测试方案。项目官方 PDF

近期研究与领域证据

项目团队近期工作提供了生态与方法背景:

  • Harrison 等(2026),獾粪便微生物组。 研究分析了 72 只欧洲獾在三年间采集的 165 份样本,发现社会群体和年龄与微生物组差异相关;部分菌属与牛结核感染概率相关,而个体之间的长期变化也不相同。这是把微生物观察与宿主及社会背景相结合的近邻案例。但该研究是观察性分析,不能证明微生物变化导致感染,也没有直接验证传播路径。Molecular Ecology 论文
  • Prescott 等(2025),猎鸟的蠕虫共感染与排毒。 研究报告称,共感染与排毒增加相关,感染强度则没有相同关系。这提示检测感染与测量更接近传播风险的排毒之间存在区别,但研究对象属于不同的宿主—病原系统。Ecology and Evolution 论文
  • Michels 等(2025),放生猎鸟与人畜共患病风险。 研究分析了放生非本地猎鸟相关的疾病风险,并讨论如何将溢出传播与相关生态驱动因素区分开来。这与本项目谨慎解释 One Health 关联的需求相关,但不能验证本项目的模型或研究系统。Ecology Letters 论文
  • Ozsanlav-Harris 等(2024),野禽移动与干扰。 研究将生物记录仪数据与干扰信息结合,发现同域的不同物种在移动和行为上的反应不同。这说明物种差异和移动背景可能是重要协变量;该研究并未测量病原体传播。Ecological Applications 论文

更广泛的领域研究正在结合病原体基因组、动物移动与环境监测。近期例子包括基于移动信息的疾病传播网络建模、对迁徙路线中 HPAI-H5 风险开展基因组和流行病学分析、利用纳米孔测序进行环境病原体筛查,以及多宿主 Usutu 病毒储存宿主建模。这些研究支持多源数据整合的价值,但物种、病原体和设计与本项目不同;它们适合作为询问采样和验证方案的背景,不代表埃克塞特博士项目将复现相同结果。 2025 年一项跨物种调查还对 973 只无症状哺乳动物进行宏基因组和宏转录组测序,用于分析野生与养殖宿主之间潜在的病原体和耐药基因共享。它展示了 One Health 监测可能覆盖的数据范围,但本身并不能证明正在发生传播。跨物种哺乳动物宏基因组研究移动驱动的疾病传播网络 · 迁徙路线中的 HPAI-H5 风险 · 纳米孔环境病原筛查 · Usutu 病毒多宿主储存模型

学校、学科与培养

官方项目 PDF 将埃克塞特大学、生态与保护中心(Centre for Ecology and Conservation,CEC)及 Penryn 校区 Stella Turk Building 列为培养环境,潜在博士学位路线为 Biological Sciences。埃克塞特介绍,CEC 有 50 多位学者,研究覆盖整体生物学、疾病、病原体与寄生虫、动物移动、分子进化、保护生物学和种群生物学。学校 Biological Sciences 页面援引 REF 2021,将该学科列为英国“世界领先”研究比例排名前 20 的学科之一;这是学校层面的学科背景信号,不是对本项目的单独评价。Biological Sciences 博士与研究学位 · CEC 疾病、病原体与寄生虫研究主题

Biological Sciences 培养路线介绍了统计编程、可迁移技能、研讨会和研究训练,并说明学生通常先注册 MPhil、再于第一年升级至 PhD,之后提交论文并参加答辩。具体注册学位名称及本名额的培训计划仍需确认。CEC 公开的设施包括 qPCR 和 DNA 毛细管测序仪等分子生物学设备,但这不代表本项目必然获配设备或测序服务。CEC 学术与研究人员

导师与实验室评估

项目列出 Xav Harrison 为主要导师,另有 Stuart Bearhop 教授、Barbara Tschirren 副教授以及英国动物与植物卫生署(APHA)的 Ruth Cox 博士参与。Harrison 研究动物微生物组、病原体、宿主健康和抗微生物药物耐药性;其团队当前项目包括獾微生物组与环境的联系、迁徙鸟类的耐药传播。Bearhop 可带来动物迁徙与觅食生态背景,Tschirren 研究疾病与寄生虫生态,Cox 从事应用野生动物疾病研究。该团队的专长组合适合将微生物数据、宿主生态和动物卫生实践联系起来,但 PDF 未分配日常指导职责,也未确认本项目可使用 APHA 数据、样本、具体野外地点或设施。Xav Harrison 的 Wild Microbiome Lab · XavLab 当前项目 · Harrison 简历与代表性成果 · Ruth Cox / BADGER 项目简介

上述论文直接展示了导师团队周边的研究:微生物组差异、感染与排毒、生态疾病风险以及动物移动。它们不证明博士生将使用同一数据或野外地点。建议询问谁负责统计分析流程、谁统筹野外和实验采样、APHA 将如何参与,以及博士生会接受哪些宏基因组学、病原确认、空间分析和模型验证训练。

研究方向与职业背景

本项目处于野生动物疾病生态、分子监测和预测建模的交叉地带。近期研究说明这种组合的价值:动物移动会改变接触机会;环境样本可能揭示单独采集宿主样本无法观察到的暴露;而感染检测也可能受到年龄、社会结构、季节或土地管理等因素混杂。一个可行的博士研究方向可以比较“只用宿主信息”与“增加环境信息”的预测能力,评估移动或季节变量贡献,或检验候选路径能否在不同地点复现。这些是基于设计的可行思路,不是项目承诺。预测应限定在实际验证过的适用范围内;除非有直接传播证据,网络结果宜称为“可能路径”。

职业路径包括野生动物疾病研究、保护和定量生态、政府动物卫生监测、计算生物学、生物信息学及更广泛的数据科学岗位。英国 National Careers Service 将动物学和数据科学列为不同职业方向;Skills England 的 2026 年评估预测,到 2035 年生命科学优先职业将新增 66,000 个岗位(44%),另有替代需求。这些是广义职业预测,不是野生动物疾病博士岗位或个人薪资的预测。APHA 是相关的公共部门雇主,但该项目不保证实习或毕业后就业。动物学职业介绍 · 数据科学家职业介绍 · Skills England 生命科学行业评估 · APHA 招聘信息

资助、申请与生活成本

2027 EPSRC DLA 采用项目竞争方式。当前申请信息说明,成功入选且符合条件的全日制学生可获最长 3.5 年资助,包括全额学费、2026/27 年度每年 £21,805 的生活津贴基准,以及总额 £5,000 的研究培训支持经费。生活津贴用于个人生活;RTSG 是研究培训和项目支持经费,不能算作额外个人收入。2027/28 年度津贴标准尚未公布。全国 DLA 页面说明,在埃克塞特成功获得国际学生全额奖学金者可通过学校学费减免覆盖国际学费差额;国际生最多占 cohort 的 30%。因此,国际申请资格不等于每位国际申请者都能获资助。签证费、移民医疗附加费和搬迁费用不在资助范围内。EPSRC DLA 资助信息

中央 EPSRC DLA 页面规定申请截止时间为 2026 年 12 月 8 日星期二中午 12 时,推荐信须于 2027 年 2 月 15 日前提交;One Health 项目 PDF 未单列推荐信截止日。中央页面概览预计面试在 2027 年 2 月 15–24 日进行,但申请流程段仍残留 2026 年面试及结果通知日期。申请者应确认 One Health 项目的申请链接和面试安排。通用 DLA 条件与项目 PDF 的量化硕士要求需分别核对。申请材料包括个人陈述、简历、成绩单、两封推荐信,以及需要时的英语成绩证明。中央 EPSRC DLA 申请信息 · DLA 通用申请信息

埃克塞特估算,在 Exeter 或 Cornwall 单人每月基本生活费约为 £1,300–£2,000,数据依据 2026 年 4 月本地开销。按当前津贴除以 12 个月,月均约 £1,817,低消费端约多出 £517,高消费端则约短缺 £183。Penryn 2026/27 年宿舍例价包括 Glasney 合住间每周 £149.66、单人间 £199.50,以及 The Sidings 标准单人间 £196.81。未来房价、房间供应和 2027/28 学年费用都未保证。英国政府要求伦敦以外学生签证申请人提供的 £1,171/月生活资金证明是移民财力门槛,不是实际生活成本估算。还应问清楚野外工作、异地交通和住宿是否另有预算。埃克塞特生活预算 · Glasney 宿舍 · The Sidings 宿舍 · 英国学生签证资金要求

申请者匹配与准备

正式要求

项目 PDF 要求申请者拥有量化学科硕士学位,并列出数学、计算机科学和统计学。EPSRC DLA 通用条件另要求相关科学或技术领域的英国一等或二等一级学位(或国际同等学历);在规定情况下,二等二学历也可能结合硕士或重要相关经验考虑。申请者应提前确认自己的学位名称和课程是否满足这两层条件。项目 PDF 没有要求申请者必须已掌握所有模型或具有野外工作经验。项目 PDF · EPSRC DLA 申请资格与流程

有利经历与准备建议

项目列出的研究方法使可复现编程、数据预处理、模型评估和特征解释成为有用准备。申请者可用具体研究或作品集说明量化建模经历,最好能展示如何处理缺失数据、类别不平衡、时空结构或外部验证。了解测序数据、生态学或动物卫生有助于生物学解释,但项目特定门槛是量化硕士,而不是要求每位申请者预先精通所有工具。随机森林、梯度提升、深度神经网络、MOFA 和网络分析是拟使用的博士研究方法,不应自动视为招生硬性条件。

下一步与待核实问题

申请前

  1. 项目是否要求已取得数学、计算机或统计领域硕士学位?申请者的具体学位和课程能否被认定为等同?
  2. 请导师确认申请对应 One Health 项目,并提供正确的项目申请链接及 12 月 8 日中午截止安排。
  3. 已确定或计划研究哪些物种、病原体、环境样本、地点和季节?预计样本量是多少?
  4. 哪些样本和测序数据已存在,由谁管理?病原确认检测和采样许可是否已落实?

面试时

  1. 如何区分污染、短暂 DNA 残留、可存活感染、主动排毒和实际传播?
  2. 哪些移动、栖息地和季节数据会与每份宏基因组样本对应?如何处理时空匹配?
  3. RF、GBM 和深度学习模型会采用哪些基线、类别平衡方法、数据划分和外部验证地点?
  4. MOFA 和网络分析如何补充预测模型?什么证据足以支持“传播路径”而不只是“关联”?
  5. 三位埃克塞特导师和 APHA 合作者分别承担什么职责?如何统筹量化分析、生态研究和野外工作?

接受录取前

  1. 取得书面确认,核实最长 3.5 年资助期、学费覆盖、国际生获奖资格、津贴标准及 £5,000 总额 RTSG 的用途。
  2. 确认 Biological Sciences 注册路径、培训安排、野外工作和交通经费、APHA 参与方式、数据使用权限及项目里程碑。
  3. 根据 Penryn 当前租房合同和个人支出预算,并确认签证、医疗附加费、搬家及野外费用需从何处承担。

证据与来源

项目、培养与学校

导师、实验室与相关论文

领域证据与方法

生活成本、签证与职业背景

信息来源

收录来源可能是学校或招聘平台;正式申请入口及最新要求请核对公告与报告中的官方来源。 查看收录来源与申请要求

按研究方向和所在国家或地区整理,优先展示资助类型相近的机会。申请前请核对各项目的最新公告。

University of Exeter · 英国

医学AI博士|用眼底影像和智能相机辅助筛查糖尿病视网膜病变

EPSRC Doctoral Landscape Award(DLA)项目,最多提供3.5年全日制奖学金、学费及3.5年总额£5,000的Research Training Support Grant。成功获奖的国际学生可由学校承担国际与本土学费差额,但国际学费身份名额最多占当届奖学金名额的30%。当前列出的生活津贴为£21,805/年并随通胀调整;奖学金摘要将金额标为2027/28,详细规则则称其为2026/27当前标准,实际2027/28金额须确认。签证、移民医疗附加费和搬迁费用需自理。

2026-12-08(具体时刻请核对原始公告)

University of Exeter · 英国

医疗数据博士|利用医院临床数据,预测住院患者发生急性肾损伤的风险

EPSRC Doctoral Landscape Award(项目编号 6017),最长资助 3.5 年全日制;包含 Home 学费、总额 £5,000 研究培训支持经费及当前 2026/27 学年每年 £21,805 生活津贴。2027/28 学年津贴尚未公布,奖学金页面摘要中的年份与详细条款不一致。符合条件并获全额资助的国际学生可能获埃克塞特大学减免国际学费差额,但国际生名额最多为 cohort 的 30%,居住资格复杂,须个别确认。UKRI 不承担签证、移民健康附加费或搬迁费用。

2026-12-08(具体时刻请核对原始公告)

University of Exeter · 英国

生态建模博士|水流会怎样改变微生物与病毒之间的共同进化?

EPSRC DLA 最长资助 3.5 年,列有 2026/27 年津贴基准 £21,805/年、本土学费和 3.5 年合计 £5,000 研究培训支持经费。成功获奖的国际申请者可获埃克塞特学费减免以补足国际学费差额,国际学费身份获奖者最多占当届 30%。2027/28 津贴待确认;签证、医疗附加费及搬迁费用自理。

2026-12-08(具体时刻请核对原始公告)

University of Exeter · 英国

气候风险博士|极端天气如何连续影响电力、交通等基础设施?

埃克塞特 EPSRC Doctoral Landscape Award:全日制最长 3.5 年,覆盖大学学费,提供按指数调整的生活津贴(2026/27 标准 £21,805/年)及合计 £5,000 Research Training Support Grant。国际生可竞争有限的全额资助名额,最多占该届 30%;埃克塞特表示获奖国际生可由校方学费减免补足国际费差额。须满足资格条件;签证、移民健康附加费和搬迁费用不在资助范围。

2026-12-08(具体时刻请核对原始公告)

University of Exeter · 英国

人工智能博士|从大脑的工作方式寻找灵感,探索如何改进AI

EPSRC DLA 奖学金编号 6010,2027 年入学,最长资助 3.5 年全日制。当前公布 2026/27 年生活津贴为 £21,805/年,另付英国学费并提供 3.5 年总额 £5,000 的 Research Training Support Grant。成功获得国际生全额资助名额者的学费差额由学校承担;国际名额不超过 cohort 的 30%,居留资格需确认。国际申请人须自行承担学生签证、医疗附加费及赴英搬迁费用,这些支出不由该奖学金覆盖。奖学金摘要将 £21,805 标作 2027/28 标准,与详细条款/UKRI 的 2026/27 口径冲突,2027/28 金额待书面确认。

2026-12-08(具体时刻请核对原始公告)