从时间序列数据推断连续时间反应模型的博士岗位

项目概览

法国 Inria 的博士岗位研究如何从时间序列推断连续时间反应模型，招聘编号2026-10631，工作地点为 Palaiseau，招聘1人。岗位为临时全日制，每周38.5小时，计划2026年12月1日开始，申请截止为2026年10月30日；当前官招只列日期，此前00:00 UTC须向申请系统确认。

博士由 François Fages 与 Sylvain Soliman 共同指导，加入 Lifeware 及其后续项目团队，并与德国 Rostock 的 Adelinde Uhrmacher 教授合作。课题属于法国 ANR 与德国 DFG 的 INCRE 合作项目，不是欧盟框架计划资助；公布税前工资每月€2,300。

岗位面向第一阶段研究者，属于博士研究机会，而非要求已取得博士学位的博士后职位。研究关联计算机科学、数学与神经科学，但具体注册学科尚未列明。

项目详情

研究重点是从时间数据学习化学反应网络（CRN）模型，Inria 团队侧重模型推断，Rostock 合作侧重基准比较。研究中既要掌握时间数据模型学习的已有方法，也要开发可用于比较和评价的软件成果。职责是承担 INCRE 项目中的部分子任务，没有额外列明项目管理职责。

博士生首先梳理时间数据模型学习的研究现状，随后开发基于束搜索（beam search）的 Reactmine-2 原型软件。研究还需设计合成基准，对 Reactmine-2 与其他方法作比较评价；进一步考察存在未观测变量时的模型推断，并在真实生物数据上评价效果。未观测变量和真实数据评价属于明确任务，不能将工作仅概括为普通时间序列预测。

研究结果将发表于科学期刊和会议，并承担相应学术交流；附加活动包括科普活动或科普出版。岗位预计每年去德国 Rostock 出差一次。国际合作是项目组成部分，但介绍没有说明每次访问时长、经费支付细则或联合学位安排。

岗位强调数学严谨性、编程能力、好奇心，以及愿意在活跃科研环境中学习、倾听和交流。语言说明中出现英语、法语和德语；正式分级列法语 Basic、英语 Good，没有为德语给出等级。不能因此把德语流利程度写成已明确的必备条件。

申请要点

• 官方岗位与申请入口：https://jobs.inria.fr/public/classic/en/offres/2026-10631 。截止为2026年10月30日；当前官招只列日期，早先00:00 UTC记录须复核，勿默认可提交至当日晚间。

• 工作地法国 Palaiseau；LE CHESNAY CEDEX、Domaine de Voluceau–Rocquencourt、78153 是机构联系地址，不能替换为实际研究地点。

• 税前月工资€2,300，当前官招确认三年固定期限合同；税后收入及薪酬变化未明确。此前招聘说明列每周38.5小时全日制，本轮官招未重列周工时，须向HR确认，拟2026年12月1日开始，时间可否协商需确认。

• 提供餐饮补贴、公共交通费用部分报销、职业培训、社会保障，以及社会文化和体育活动。每年有7周年假及10天 RTT 工作时间缩减补休；符合条件时还可申请子女生病、搬家等特别休假。可采用灵活工时和一定远程工作安排，具体额度及执行条件按岗位说明。 本岗还提到可使用视频会议、借用计算机等专业设备。

需要进一步确认

当前官招要求研究生学历或同等资格、属于新毕业生博士岗位，合同三年。授予学位的大学、博士院准入细则、完整申请材料、国际申请者手续和具体语言证明仍需确认。可向两位导师讨论模型学习、Reactmine-2 开发、基准评价和真实数据分析的分工；介绍中的部分合作模板语句不完整，不宜据此推断额外资格或承诺。

Inria LIFEWARE博士项目研究报告：从时间序列推断连续时间反应模型

决策概览

机会较强，需核实方向与条件。 这个项目要解决的是：面对只观察到部分变量的时间序列，能否推断有解释力的动力学模型，而不只是拟合一条曲线。博士核心是数学、算法和软件，生物数据是评价场景。优势在于已有直接前序软件、两位具名导师及法国—德国合作。官方确认这是面向新毕业生的三年博士岗位，拟2026年12月1日开始，2026年10月30日截止。海外申请者首先需要核对博士注册、工作语言及可能适用的安全审批，开始日期留出的行政时间很短。当前官招只列截止日期；此前记录的00:00 UTC须再向申请系统确认，不应默认可用到当日晚间。官方职位。

研究问题与博士工作

时间序列记录的是选定的观测量，无法直接展示产生这些变化的全部过程。不同模型可能解释相近的数据，因此拟合好坏之外，还要判断哪些结构结论有依据、哪些依赖假设，以及部分变量未被观察时结论是否可靠。前序Reactmine研究报告了模拟数据和两组真实数据，包括细胞周期与昼夜节律相关观察；这些结果支持继续研究，却不意味着任何机制都能被唯一恢复。Reactmine预印本。

招聘列明的工作包括文献调研、基于束搜索开发Reactmine-2原型、设计模拟基准并开展比较、处理未观测变量下的模型推断，以及在真实生物数据上评价。发表论文、会议交流和科普也是职责。研究重心是模型与软件的开发和评价。

ANR–DFG的INCRE项目连接LIFEWARE与罗斯托克大学Adelinde Uhrmacher团队，招聘预计每年赴Rostock一次。当前团队首页列2026—2030年，Research合同小节则列2026—2029年，属于同一官方站点的年限分歧，应向协调人确认。模型推断与独立基准评价的合作是优势；个人岗位明确为三年，不能据合作项目的结束年份推断联合学位或第四年工资。团队首页、在研合同。

可在面试讨论的研究问题包括：如何区分模型选择与参数估计，怎样表达隐藏变量带来的不确定性，怎样公平比较模型复杂度，基准构造是否会偏向某种方法。这些是本报告提出的讨论方向，不是已经承诺的里程碑。合理成果可能包括推断方法、可复现软件和范围明确的实证评价；实际成果取决于研究进展。团队的软件积累有帮助，但Reactmine-2代码成熟度、许可证和真实数据使用权仍需确认。软件资源。

学校、学科与培养

Inria是雇主和科研接收机构，此职位尚未明确授位学校。 LIFEWARE位于Palaiseau的巴黎综合理工校园、Inria Saclay中心。周边数字科学环境有大学合作关系，在建模、仿真、优化、数据和可靠系统方面有研究资源；校园位置或合作关系不能直接等同于巴黎综合理工或巴黎萨克雷大学学位。研究中心环境。

团队名单中有通过ED IPP注册的博士，也有ENS Paris-Saclay／ED STIC学生。2025年年报记录Fages协助Inria博士在ED IPP注册的职责，说明存在实际路径，但不能代替本岗位确认。接受offer前应明确博士院、注册与授位机构、学位名称及境外硕士等效认定。团队与注册信息、2025年报。

本项目的学科信号来自形式方法、计算系统生物学、研究软件和国际基准合作的集中，而非套用邻近大学排名。授位机构尚未确认，因此不指定数值排名；综合大学名次本身也不能衡量这个专门团队。IP Paris博士手册可作为三年研究培养和当地国际科研环境的背景；法国国家博士平台则区分导师同意、实验室接收、博士院录取和学校注册四个环节。博士手册、注册步骤。

培养还应包括学科课程和可迁移技能训练，不能只依赖非正式代码指导。个人培养计划、跟踪机制和课程要求以最终博士院为准。国家培养指引。

导师、团队与近期论文

François Fages是Inria特级研究主任（DRCE）、领导LIFEWARE，研究涉及理论计算机科学、逻辑和计算生物学；Sylvain Soliman侧重形式推理和计算系统生物学。两者结合适合重视数学假设、算法和科学解释之间联系的研究路线。若期待主要做实验生物学或通用深度学习，这个博士的核心工作有所不同。Fages主页、Soliman主页。

三篇近期成果分别说明直接基础与相邻专长：

• Reactmine：2022年发布、2023年修订的预印本，由Martinelli、Grignard、Soliman、Ballesta和Fages合作。提出统计模型搜索，并在模拟及真实数据中比较，是Reactmine-2的直接前序。此次查阅的是arXiv，未确认同行评审发表状态。它提示推断及公平比较问题，不能证明后续模型一定可识别。论文。
• AAAI 2024的布尔网络陷阱空间可扩展枚举：Trinh、Benhamou、Pastva与Soliman提出答案集编程方法，在250多个真实及400多个随机网络上评价，主要性能比较指找到首个解的时间，不能扩大为所有解的枚举速度。它支持团队的算法与基准经验，但布尔网络分析不同于定量连续时间模型恢复。已发表论文。
• 具有绝对功能鲁棒性的在线模拟计算：Hemery与Fages的2023年arXiv稿，团队列为2024年《Theoretical Computer Science》991卷114432文章。数学刻画及误差分析显示其重视假设和保证；这是相邻理论，不是从真实数据恢复机制的实验证明。此次查阅稿。

团队有研究工程师、在读博士、软件与持续发表活动。2024年报还展示形式、逻辑和随机建模及合作，说明研究广度；不能据此保证每名合作者都会指导本博士。招聘提到后续团队，应面谈三年监督连续性、决策责任及日常编码支持。2024年报、团队概况。

资金、申请与生活成本

月薪为**€2,300税前**，有社保、餐食补助、公共交通部分报销、七周年假加十天RTT、培训及弹性工作安排。按月额不变计算，一年税前€27,600、36个月€82,800；这些是扣款前工资总额，不是可支配收入。未见必须另获CSC资助的条件。此前招聘记录列每周38.5小时，本轮官招未重列周工时，须向HR复核。

未发现中国国籍排除条款，但这不等于个人资格或签证保证。境外学历等效与博士录取仍须批准。岗位可能位于ZRR限制区，若部长级审批不利，招聘会取消。国家指引允许符合接收与资金条件的非欧盟博士研究人员申请人才研究者居留路径，雇佣offer本身不保证居留获批。科研接收协议、博士研究框架。

博士不适用国际本科、硕士的较高差别学费，但Campus France当前2026—2027说明自身存在€397和€398两种博士年费数字。因此应以注册学校账单及报销规则为准，本报告不承诺免注册费、固定CVEC或全部费用减免。学费指引。

Palaiseau属于巴黎大区，实验室可从Massy-Palaiseau转公交到达。IP Paris手册列示参考租金至少€500／月、食物约€300／月，其中其他行政和交通价格含旧数，不能当作2026报价。Campus France于2026年7月更新的说明也将平均食物支出列在每月€300左右。两项相加得到**€800的部分预算**，尚未含水电、保险、交通和其他消费。实验室交通、当前预算参考。

仅为比较，可在这部分预算上另留€300—700，形成每月€1,100—1,500、每年€13,200—18,000的规划情景。这是本报告透明列出的假设，不是测得的Palaiseau平均水平，也不是住房报价。应以真实租约和HR税后估算比较，另备押金搬迁费用，并确认Rostock交流是否报销；不能用税前工资差额预测储蓄。

背景、准备与职业含义

官方基础条件是研究生学历或同等资格、数学严谨性、编程能力、好奇心及学习沟通意愿。此前招聘说明列英语良好、法语基础，官方叙述同时提到英语、法语和德语，但未给德语等级。德语究竟为必需还是合作便利需直接问清，不应自行增加证书门槛。

建议准备，非额外硬门槛：一份规模适中、可复现的模型或科学计算作品，展示处理噪声观察和数值验证的能力，并说明模型能识别与不能识别的部分。招聘未规定论文数量、必须有高级实验背景或指定编程语言；团队广泛研究兴趣不能变成每个方向都要精通的条件。

科学软件、定量建模、优化和可复现评价可迁移到研究工程、建模团队和数据密集研发。团队列举IBM、Servier、Novadiscovery及学术岗位等去向，是选择性自报案例，不是就业率。法国2025年科研就业报告显示公私领域需求，同时历史数据提醒固定期限研究工作的风险；它不能预测2029年个体就业或移民结果。科研就业报告、博士技能。

下一步与分阶段确认

申请前：10月30日前通过Inria官方系统申请，向Francois.Fages@inria.fr核对注册学校、学历等效、语言和12月开始的可行性。此职位没有完整列明材料清单，按申请表要求准备，不能借用其他岗位清单。

面试时：讨论Reactmine-2与前序方法的差别、隐藏变量结论的可验证边界、可用基准与真实数据，以及LIFEWARE、后续团队和Rostock之间的编码及指导分工；问清年度出差、署名和开源许可。

接受offer前：拿到三年合同、税后估算、费用承担和注册确认，核对住房与出差支持、移民／ZRR流程，以及全周期指导安排。最终判断取决于数学研究优势能否落实为三年内可执行的注册和研究计划。

证据与来源

• Inria 2026-10631: Inferring Continuous-Time Reaction Models from Time-Series Data
• LIFEWARE research team and current highlights
• LIFEWARE research contracts and programme
• LIFEWARE team and former members
• François Fages professional profile
• Sylvain Soliman professional profile
• LIFEWARE software resources
• LIFEWARE annual activity report2024
• LIFEWARE annual activity report2025
• Reactmine: a statistical search algorithm for inferring chemical reactions from time series data
• Scalable Enumeration of Trap Spaces in Boolean Networks via Answer Set Programming
• Online analog computation with absolute functional robustness
• LIFEWARE address and access
• Université Paris-Saclay: Inria Saclay research environment
• IP Paris PhD welcome booklet
• Campus France: preparing a budget, updated7July2026
• Campus France: tuition fees, updated25June2026
• French national doctoral platform: admission and registration steps
• French national doctoral platform: research hosting agreement
• French national doctoral platform: personalised doctoral training
• French national doctoral platform: doctoral research frameworks
• French national doctoral platform: transferable doctoral skills
• French Ministry: scientific employment report2025