巴斯大学工程与设计博士奖助：解脂耶氏酵母全基因组尺度代谢模型与废弃营养流资源化

项目概览

巴斯大学化学工程系拟研究工业相关微生物的全基因组尺度代谢模型（Genome Scale Metabolic Models，GEM），关注农业及／或细胞培养产生的废弃营养流如何用于可持续细胞农业。公告以解脂耶氏酵母（Yarrowia lipolytica）为示例，结合计算模型、组学数据与台架尺度发酵验证。联系人为Akin Odeleye博士，正式申请化学工程博士。本题与工程与设计学院其他课题共同竞争奖助，是否获奖取决于遴选。

项目详情

公告援引文献指出，农业食品系统约占全球温室气体排放的三分之一，并以此说明可持续食品系统的重要性。可持续性也是巴斯大学细胞农业制造中心的主要使命之一。课题关注循环利用与废弃营养流的价值，探索它们在可持续细胞农业生产中的作用；这里的减排与可持续效益属于研究背景和目标，不能据此认定本题工艺已经证明环境收益。

精准发酵是细胞农业的一项支撑技术，可通过微生物培养生产油脂、蛋白质等食品相关产品。公告认为，功能基因组学与细胞代谢网络数学模型的发展，有机会帮助研究采用农业废弃物流等非传统原料的菌株与工艺。本题将建立工业相关微生物的GEM，为使用农业及／或细胞培养废弃营养物作为原料的精准发酵研究提供依据。公告也把模型用于未来计算研究和成本分析作为长远设想；具体研究范围尚须与导师确认。

研究分为三个相互关联的方向。首先，为工业相关的精准发酵微生物建立基础GEM，示例物种为解脂耶氏酵母。其次，开展使用不同废弃原料的台架尺度发酵研究，取得转录组和代谢组数据，使模型反映具体研究情境。最后，利用整理后的模型分析废弃营养流的资源化潜力与经济可行性，并结合相关观测评价模型解释力。这些是拟开展的模型与验证工作，尚非已经确定的成本优势或工业成果。

申请者须已取得或即将取得英国一等／二等一级荣誉学士学位，或国际等值资格；硕士资格有利。相关学科包括化学工程、生化工程、生物技术、生物工程、计算机科学或紧密相关领域。公告另说明，也可能考虑持一等BSc／BEng荣誉学位且能证明有显著相关产业或研究经验者，具体资格应按个人材料确认。

以下任一领域的经验或强烈兴趣都受到重视：GEM、Python／MATLAB编程与数据分析、微生物发酵（公告举酵母和大肠杆菌为例）及／或细胞培养、培养基开发与分析。这些是受到重视的经验或兴趣，申请者无需同时具备全部经历。

申请要点

须通过巴斯大学在线申请表正式申请化学工程博士（PhD in Chemical Engineering）。该培养项目最多申请两个课题。在“Funding Your Studies”下拉菜单中选择“University of Bath URSA”；在“Your PhD project”部分，把完整题名填入“PhD project title”，主导师姓名填入“Name of intended supervisor at University of Bath”。第二志愿题名填入“Project 2 Title”，相应导师填入“Name of intended supervisor for 2nd choice project at University of Bath”。漏填或填错这些字段可能造成自动处理错误，使申请未被纳入相应课题考虑。

鼓励先作非正式咨询，邮箱为aooo27@bath.ac.uk。非英国申请者若目前不在英国就读，必须在申请截止前满足该培养项目的英语要求，原文明确不考虑例外，但未列具体考试分数。项目公告只列2026年11月29日；2026年10月的工程URSA条款补充截止时刻为当日23:59 GMT。如获奖助，预计2027年10月4日开始；其他日期须经拟任导师及Doctoral College同意后安排。

奖助面向本地及海外学生，海外名额依UKRI政策设上限，公告没有比例。支持包括学费、每年1,000英镑培训经费和生活津贴；21,805英镑是2026／27学年标准，不能当成已确认的2027／28个人金额。国际学生须自费承担学生签证及移民健康附加费，培训经费也不能作为个人生活现金。个人总资助月数尚未给出。

学校鼓励代表性不足群体申请，重视包容研究环境。若有影响学业表现的特殊情况，可在申请表说明，建议放在个人陈述末尾的一小段。申报残障后，Disability Service会联系申请者，讨论所需支持。

需要进一步确认

应确认首阶段采用的研究对象与废弃营养流范围、建模与实验工作的分配、数据和培训安排，以及英语证明、完整申请附件、个人奖助期限和2027／28金额。公告没有给出具体原料方案、数据集或个人资源使用安排，不能把未来模型能力与经济性目标写成已实现成果。

公告所列参考资料包括《Nature Food》“Food systems are responsible for a third of global anthropogenic GHG emissions”、Feigin等发表于《Oxford Open Climate Change》5卷1期（2025）的“Solving climate change requires changing our food systems”，以及CARMA Sustainability Statement（2026年6月文件）。以上是公告所列参考资料，尚未独立审读。

上述课题及资助信息对应2026年10月的申请资料；提交前应向联系人确认本题目前是否仍有名额及条款有无变化。

巴斯大学工业酵母代谢模型博士研究报告

项目判断

值得重点了解，需核实模型基础与培养安排。本题将全基因组尺度代谢模型与工业酵母、废弃营养流数据结合，研究计算结果何时能支持实际生产判断。Akin Odeleye的当前建模论文及CARMA职责与方向相关，但模拟可行并不等于工艺已经可持续。2026年10月的URSA条款提供包含海外学费和生活津贴的国际竞争路径，个人金额与期限仍待确定。首次咨询宜问清起始模型、数据来源，以及计算和实验两部分由谁指导。项目截止为2026年11月29日，当前学院URSA公布的具体时刻为23:59 GMT。

研究问题与博士工作

公告关注农业及／或细胞培养废弃营养流能否用于精准发酵研究，示例工业酵母为解脂耶氏酵母（Yarrowia lipolytica）。拟开展的工作将基础全基因组尺度代谢模型与转录组、代谢组证据结合，并开展台架尺度验证。食品原料和生产循环性是研究背景；成本下降、减排与具有商业可行性的表现，均不能当成本博士已经取得的结果。

科学难点在于数据与原料条件变化时，模型是否仍然有效。代谢网络能描述哪些过程可能发生，却未必唯一决定某一培养系统实际怎样表现。Odeleye参与的2026年论文提供了直接提醒：在其哺乳动物细胞案例中，常规模型未充分反映部分应激情境，引入过程信息后改善了所报告的预测。这支持研究模型假设与观测之间的关系，但不能直接证明酵母或农业废弃物情境下有同样精度。相关依据限于原始摘要及元数据，不涵盖全部方法或原始数据。2026年代谢模型原研。

博士研究需要说明观测数据的来源和质量、怎样表达不确定性，以及模型能否解释未参与拟合的数据。测得的浓度、推断的代谢量和模型预测需要分开。这些是根据项目与论文提出的分析重点，不是公告已经确定的验证流程。具体酵母模型、废弃营养流来源、数据许可、实验分配和首年成果尚未公布。

循环利用还需要系统边界。废弃原料的收集、处理、质量保证和后续加工，都可能产生额外负担。预测更准确本身不能证明食品工艺环境影响更低。CARMA研究框架明确包含全生命周期价值，以及环境、经济与伦理可行性，可据此询问论文将支持哪些比较，但不能据此认定本题已有完整生命周期评价或技术经济评价。环境改善结论仍须有合适的对照及明确的不确定性范围。CARMA循环制造研究框架。

学校、学科与培养

正式学位为巴斯大学化学工程博士，代码RECE-AFM02。现行课程全日制正常学制四年，最短两年，包含博士预备注册、确认考核、受指导研究、论文提交与口试，由巴斯大学授予学位。CARMA跨校活动，以及导师此前的牛津和产业联系，都不代表联合博士、雇佣合同或个人实习保证。化学工程博士课程。

化学工程系覆盖化学、生化、材料与资源过程研究。Odeleye官方档案列其属于数字、制造与设计中心The Foundry；CARMA另列其细胞农业职责，两者与计算及实验生物过程研究相关。个人课程、分析设施、技术支持及日常训练分工仍须商定。学校MyDoctoralDevelopment提供一般博士能力训练，不能代替本题具体培养计划。导师现任学术档案、CARMA团队、博士专业能力发展。

巴斯大学REF2021提交的工程联合评估单元中，96%的研究获世界领先或国际优秀评价，其中涵盖化学工程，并非本导师或工业酵母建模的单独排名。QS2027总榜列学校第125位。这些结果提供学校背景。具体培养还取决于模型、数据分析和实验解释能否组成连贯的博士研究。四年正常学制也应与URSA一般资助上限分开理解。REF2021研究结果、QS学校总榜。

导师、团队与原研证据

Akin Odeleye现任化学工程Lecturer，属于讲师职级，官方邮箱为aooo27@bath.ac.uk，ORCID为0000-0002-0146-1111。CARMA列其承担工作包1相关工作，方向包括细胞农业生物过程、数字工程和流体动力学，具化学及生化工程训练和产业经历。招聘只列他一位导师。中心同事、论文共同作者和此前雇主，均不能自动作为正式共同导师、实习提供方或本人的资金来源。Odeleye现任身份、CARMA职责与背景。

文献依据包括三篇共著原研，其中只有一篇属于2022—26年。Wee等2026年《Biochemical Engineering Journal》110325将酶约束代谢模型与经验性过程信息结合。完整原始摘要报告了CHO细胞案例中的预测改善，数据声明为按请求提供。官方记录确认2026年7月22日已提前在线发表，尽管卷期日期是11月，因此并非尚未发表的未来成果。它与本题相关的是模型和过程信息的结合，研究对象、数据集与性能数字不能直接套给工业酵母。相关依据不涵盖完整方法、原始数据和补充资料。当前代谢建模原研。

Odeleye等2020年同刊107515将计算流体动力学、增材制造和原型比较用于哺乳动物细胞生物反应器。相关依据限于机构完整原始摘要及出版方索引中的引言、结论片段，能看到计算与实物验证相连接的研究基础；它是较早的工程成果，不能充作近期酵母GEM验证。Nguyen等2019年《Scientific Reports》3477比较响应性载体和细胞质量指标，相关依据限于原始结果、讨论、结论及贡献说明的选段。这项工作区分了生产数量与保留的生物质量，但没有证明本题废弃营养流的表现或食品安全。Odeleye在该文参与验证和分析，不能称其独自领导了整项研究。2020年生物反应器原研、2019年材料与细胞原研。

这些成果支持生物过程建模方向，但近期酵母专门研究的广度及具体指导条件仍需问清。CARMA团队有营养回收和酵母相关专长，中心成员身份本身不保证个人能获得全部支持。应确认谁指导模型整理、数据解释和实验，多久讨论一次，以及支持人员是否贯穿博士阶段。训练可能通向计算生物过程、食品制造或工艺研发岗位，不能承诺产业职位、商业成功或固定实习。

资金、申请与生活成本

本题明确要求申请URSA。2026年10月的工程与设计学部信息列明，2027年10月入学轮次截止2026年11月29日23:59 GMT，项目源文则只给同一日期、没有钟点。预计2027年10月4日开始，其他日期须导师及Doctoral College同意。官方资金包含本地或海外学费、生活津贴及每年最高1,000英镑培训支持，构成积极的国际竞争路径；不能因个人尚未获奖就否定机会。源公告提到海外名额上限，但没有比例。当前URSA条款。

工程学院一般最长支持3.5年，化学工程博士正常学制四年。个人奖助月数、2027年津贴、续期和写作阶段安排未知。21,805英镑仅为2026／27参考金额，培训支持也不是可支配生活现金。学校2027／28海外工程研究学费为每年31,350英镑，并有年度上涨条款。若奖项覆盖该项费用，不能在没有核对录取条款时再将其算作额外个人账单。额外研究费（bench fee）及资助期外费用仍须确认。奖助金额与期限、工程研究学费。

巴斯大学2025／26研究生样本预算为每周405英镑，按52周为21,060英镑；校管住宿平均参考每周230英镑、合同51周。这些是带年份的规划资料。与21,805比较仅余745英镑，但跨了参考年份，不能预测2027年实际结余。房型、暑期住宿与物价变化都会影响预算，样本也不含机票、学费和移民费用。官方生活预算。

2026年10月的学生签证申请费参考为558英镑，学生IHS为每签证年776英镑，总额受有效期及不足整年规则影响。URSA明确由学生承担签证与IHS，即使学费获支持也要准备前期搬迁资金，办理时还应重核费率。本题没有列公司雇佣安排，以往论文或中心经费不能代替个人奖助。英国学生签证、医疗附加费。

申请背景与准备

公告要求已取得或即将取得一等或2:1荣誉学位，或国际等值资格，硕士为优势。学科包括化学或生化工程、生物技术、生物工程、计算机科学及相关领域；另提可能考虑持一等BSc／BEng并有显著相关产业或研究经验者，应结合成绩单询问这一路径的适用方式。模型、编程与数据分析、发酵及细胞培养、培养基分析等领域的经验或强烈兴趣受到重视，原文没有要求四类经历全部具备。

对中国申请者，课程面向国际等值学历，URSA明确覆盖海外学费，支持原则可行性。当前国家资格信息没有给出统一中国博士百分制门槛，授课型研究生分数不能移作博士标准。课程一般接受一等／2:1等值或Merit硕士等值，也允许具体项目另有要求；不能假设硕士自动免除本题本科及专业条件。课程资格要求、国际学历指引。

化学工程要求IELTS总分6.5、各项至少6。TOEFL iBT及Home Edition在2026年1月21日前考试采用总分90、各项21，此日起的新量表为总分4.5、各项4；通常须在开学前24个月内考试。符合条件的近期英语授课学位可能获得个案豁免，中国院校英语授课并不自动获免。非英国申请者若目前不在英国学习，必须在申请截止前满足语言要求，公告明确没有例外；普通语言班或有条件入学安排不能推迟这一资助条件。课程英语要求、博士英语政策。

现行指南要求最新CV、学位证书、成绩单、适用的认可英文译件、个人陈述、资金计划及研究详情。需两位推荐人，至少一位为近期学术推荐人，拟任导师不能担任。自拟课题1,000词研究计划规则不能直接套为已公布项目的硬要求。申请须选URSA并填写完整题名与导师，最多两个课题。学校禁止用AI生成申请文本。化学工程为ATAS覆盖课程，中国国籍不豁免，但这是个案审批要求，并非入学禁令。当前博士申请指南、ATAS规则。

下一步与待核问题

申请前，联系Odeleye确认起始工业酵母及现有模型、可用废弃营养流观测，以及计算和实验训练的分工。学历等值或英语豁免存在疑问时，应在11月29日前取得确认，备好指南要求的CV和附件，并准确填URSA两志愿字段。招聘信息对应2026年10月17日，课程、导师及资助部分采用相关2026年10月信息；个体课题是否仍有招收容量，应直接咨询，不从一般政策推断。

面试可讨论如何解释模型与数据不符，什么算独立验证，以及可持续工艺判断采用何种边界。再问清哪些技能由团队培训、各环节由谁支持。即使没有商业化食品工艺，具有清楚适用范围的可靠模型也可形成博士贡献。可请导师介绍这里讨论的一篇近期建模论文及两篇较早成果之外，近期酵母方向的工作。

接受前，取得个人资助月数、2027年生活津贴、学费与研究收费覆盖，以及第四年剩余费用安排。另核数据许可、技术支持、指导频率、知识产权和产业访问预期，与招生方商定ATAS、CAS和搬迁时间。这些待核事项影响可行性，应在已确认的国际资金竞争框架内逐项解决。

证据与来源

研究、导师与原研

• Akin Odeleye现任学术档案
• CARMA团队与导师职责
• 2026年过程信息与代谢模型原研
• 2020年生物反应器设计原研
• 2019年响应性载体原研
• CARMA全生命周期循环制造框架

学校与博士培养

• 巴斯大学化学工程博士课程
• 巴斯大学REF2021结果
• 博士专业能力发展
• QS巴斯大学总榜信息

资金、申请与生活成本

• 2027年URSA竞争奖助
• 当前博士申请指南与CV要求
• 巴斯大学博士英语政策
• 巴斯大学国际学历资格指引
• 2027／28工程研究学费
• 2025／26研究生样本预算
• 英国学生签证要求与费用
• 英国医疗附加费
• ATAS专业与国籍规则