EASTBIO CASE:结合电子鼻与机器学习,通过气味检测和区分微生物
项目1690 · University of Dundee · School of Life Sciences
- 所在国家或地区
- 英国
- 申请截止日期
- 2026-11-16(具体时刻请核对原始公告)
- 资助信息
- 四年竞争性 EASTBIO BBSRC 资助,面向英国及国际学生;支付 UKRI 标准生活津贴与本土学费,邓迪大学承担国际学费差额。包括强制培训和三个月实习;具体津贴金额与其他费用未列明。
申请工作台
保存项目,围绕当前机会准备申请。截止日期和资格请以原始公告为准。
项目介绍
项目概览
邓迪大学生命科学学院招收一项 EASTBIO CASE 博士,研究能否利用微生物产生的气味,结合电子鼻技术与机器学习,检测并区分不同细菌。导师为 Varsha Singh 博士和 Didier Ndeh 博士,产业合作方为提供土壤分析技术的 PES Technologies Ltd。项目位于英国邓迪,申请截止为 2026 年 11 月 16 日。
项目详情
项目介绍指出,地球可能有多达一万亿种微生物,其基因编码的酶具有多样代谢能力,并援引研究说明人类肠道微生物组中细菌基因的高度多样性。这些酶代谢碳水化合物、氨基酸和脂肪酸时,会产生挥发性有机物(VOCs),包括醇、醛、酮、芳香族化合物及杂环分子。
包括铜绿假单胞菌在内的重要人类病原体,可产生具有一定特征的挥发物组合,因而可能形成诊断线索。团队已发现,机器学习能够根据挥发物特征进一步区分铜绿假单胞菌与大肠杆菌。博士将在这一基础上研究更广泛的细菌;目前的说明没有把两种细菌的区分结果等同于已经完成多菌种诊断系统。
研究首先采用气相色谱—质谱方法,识别最多 50 种致病及非致病细菌的挥发性有机物,再利用机器学习对其进行区分。随后,学生将使用产业伙伴提供的电子鼻,结合挥发物特征模式与机器学习,开展不同细菌的检测与分辨。具体菌种清单、采样条件及系统性能指标没有列出,不能据此预设临床诊断效果。
训练跨越微生物学、气相色谱、传感和机器学习。学校还提供通用能力培训、与科研及产业人员交流的机会,以及贯穿博士阶段和后续职业发展的指导。EASTBIO BBSRC Doctoral Landscape Award 提供四年博士资助,学生须参加规定的培训,其中包括一次三个月实习。实习是培养安排,具体接收单位及是否安排在 PES Technologies 尚未说明。
项目介绍表达了欢迎不同背景有潜力申请者、扩大高等教育机会的立场。这一声明与国际生资助说明共同构成公开招生信息,但个人录取仍需满足大学及培养项目的要求。
项目介绍援引数据称,单个人类的肠道微生物组包含超过 4,600 万种独特细菌基因;这一数字在此保留为介绍中的研究背景,并不意味着本博士将逐一分析这些基因。
申请要点
该项目属于面向全球学生的竞争性资助项目,不能把进入申请流程理解为已获得奖学金。资金覆盖 UKRI 标准生活津贴和英国本土学费;邓迪大学明确承担本土与国际学费差额。说明没有列出生活津贴的具体年度金额,也没有说明签证、移民医疗附加费、机票或家属费用是否覆盖。
申请方式请查阅邓迪大学的 BBSRC EASTBIO Doctoral Training Partnership Studentship 项目页面。项目介绍没有列出完整材料清单、学历或成绩门槛、英语考试分数及最终评审方式,不能把本项目拟培训的机器学习、色谱或传感方法全部改写为既往经验硬要求。
学校与博士培养
邓迪大学授位,生命科学学院承接;PES为产业合作方,并非额外学位或雇佣合同。QS2027综合并列447与学校所引REF2021生物科学英国领先、全校84%世界领先或国际优秀属不同口径,不能衡量个人指导。EastBio前两年核心培训,2026/27课表不是2027保证;三个月实习、CASE与PIPS衔接及接收单位待核。注册名称、进展评审和论文要求以个人录取及入学材料为准。生命科学学位
资格与提交路线
相关Honours或Master等值为课题期待;网络通常2:1且不统一强制硕士,较低本科加硕士或显著职业经验可个案评估。邓迪中国研究学位通常需良好大学硕士水平及研究经历,本科直博须个案认定,未核得中国百分线。现有生命科学IELTS6.5、听读5.5及口写6.0,其他证据与2027条件另核;后补语言不免正式入学条件。中国研究学位路径
按保存的2027指引将EastBio表及成绩单发EASTBIOapplications@dundee.ac.uk,填匿名EDI回复ID;两位非本项目导师推荐人将模板发同邮箱,额外CV不予考虑,全网络仅投一个课题。DOCX字段未另读,不虚构篇幅。11月16日无钟点证据,项目2027年9月与网络10月1日须确认,普通大学申请不能替代本轮预申请。保存申请指引
费用与职业范围
£21,805及简单月均约£1,817是2026/27参考,非2027/28个人报价。培训预算前三年各£5,000、第四年£1,000不是额外生活收入;年度国际名额上限30%非个人成功率,CASE导师可提名两人不等于两个资助位。获奖者国际学费差额由Dundee承担,不等于所有申请者均获奖。
签证/IHS不由EastBio承担;已存£558及每签证年£776按实际期限预缴、未来价格另核。£10,000–12,000生活估计为39周,2026Q1一居整套月£645/两居£839,2025年9月非房租£700–800;一居情景合计月£1,345–1,445,相对月均津贴余£372–472未扣签证、旅费、押金及通胀,不是2027房源或储蓄保证,博士预算须覆盖暑期。
中国不属ATAS国籍豁免,本题是否需要由实际代码与offer确认,不是一律批准或拒绝;学术录取、竞争奖助和CAS/签证分别决定。化学测量与可复现数据分析可衔接科研产业;BLS2025–2035增长6%只为美国微生物职业大类,不是英国/中国招聘或个人工资,博士不自动取得临床检验执业资格。产业合作不保证岗位、家属补助或额外工资。
需要进一步确认
需核实正式申请入口及材料、学历与语言条件、国际申请者参与资助竞争的具体规则、入学时间及四年各年度待遇。研究上需确认获准范围、微生物/测量/分析指导分工、数据及设备权限和三个月实习地点费用。
收录来源可能是学校或招聘平台;正式申请入口及最新要求请核对公告与下方报告中的官方来源。
项目深度调研报告
报告生成记录:。生成日期不代表招聘方确认项目仍开放。
资料更新记录:。申请前请再次核对原始公告。
PhD 项目深度调研报告:结合 GC-MS、电子鼻与机器学习识别微生物气味
研究问题与申请判断
这项博士先用分析化学识别细菌的挥发物,再检验产业传感器能否可靠区分细菌。学生将把微生物实验、GC-MS 测量与预测建模结合起来。Dundee 公布四年 BBSRC 支持,2026/27津贴参考为每年21,805英镑,申请截止为 2026 年 11 月 16 日。成功获奖的国际生有明确的海外学费差额减免安排,但须在 EASTBIO 海外生最多占年度资助名额 30% 的规则下竞争。官方项目介绍;现行资助 FAQ。
申请前应先与 Varsha Singh 讨论研究,再向 Dundee 确认中国学历条件。邓迪现行 EASTBIO 培养计划页面曾列本项课题开放,并提供2027年表格链接和邮件渠道;保存记录不等于新核当前名额。项目页面写 2027 年 9 月入学,EASTBIO 统一日程则为 10 月 1 日,这项差异仍须确认。奖学金、大学正式录取与签证是分别审批的事项。
研究问题与博士工作
微生物挥发性有机物(VOCs)既受物种影响,也反映代谢状态。难点在于判断哪些信号来自细菌本身,哪些差异只是由培养基、培养时间、菌量、湿度或实验批次造成。如果模型实际上识别的是培养条件或采样日期,内部测试表现再好,也可能无法推广到新培养物。传感器检测到某种指纹,也不同于鉴定出全部化学成分,更不等于已经把细菌从样本中物理分离出来。
项目拟用气相色谱—质谱分析最多50种致病及非致病细菌的挥发物,利用机器学习建立区分方法,再应用 PES Technologies Ltd 提供的电子鼻。团队介绍了利用气味区分铜绿假单胞菌与大肠杆菌的初步发现,但没有给出独立测试集规模、交叉验证准确率或临床验证结果。因此,扩展到多种细菌属于博士拟开展的研究,不能当作已经完成的 50 菌种诊断产品。项目研究任务。
尚未解决的是已观察区分的适用范围:现有资料没有确立跨菌种、混合样本或不同测量背景的表现,也没有证明化学谱与传感器信号支持完全相同的结论。获准范围、生物安全及微生物/分析/建模分工须由接收团队说明。
应用价值涉及微生物表型、分析传感器及环境、产业检测。PES 将 ScentsCheck 用于土壤健康分析,说明产业合作具有实际场景,但公司产品介绍不能替代感染性病原检测的独立验证。PES 产品应用。下文 2021 年的原创气味研究提供较直接的机理背景,近年的其他研究则提示,营养与生理条件限制结论的推广。
学校、学科与培养
学术接收与授位机构是英国苏格兰的 University of Dundee,所在单位为生命科学学院。EASTBIO 是博士培养与资助伙伴计划,不是第二所授位大学;PES 是产业合作方,也不因此提供另一份学位。Varsha Singh 为主要导师,Didier Ndeh 为第二导师。具体课题写明四年培养,包含强制培训和三个月实习。CASE 产业实习怎样安排、与 PIPS 是什么关系,仍应按本岗确认,不能直接套用较早学生手册。
Dundee 在 QS 世界大学排名 2027 中位列并列第447位。与课题更接近的证据是,大学依据 Times Higher Education 对 REF 2021 的解释,称其生物科学为英国排名最高的大学,并列出全校送审研究有 84% 被评为世界领先或国际优秀。这是英国历史科研质量评估,不是 2027 年全球学科排名,也不是对这个团队电子鼻或机器学习指导能力的排名。具体导师采用什么方法、已经完成哪些研究,更能说明这个博士课题的条件。QS 2027 排名;REF 2021 结果。
EASTBIO 当前训练结构以前两年的核心科研方法、群体活动和专业能力为重点,第三、四年更集中于研究,同时保留额外训练机会。它是有统一训练安排的博士群体项目,不能理解为四年都必须上同样课程,或保证采用轮转培养。现有 2026/27 课程表面向在读学生,2027 年新生的具体课程可能变化。培养结构。
生命科学研究学位页面要求先完成预申请,再递交大学标准申请;跳过预申请可能导致正式申请被拒。EASTBIO 选拔与接收大学的正式录取需要衔接,持学生签证者须全日制注册,并在学校可通勤范围内生活,实地研究和许可实习期间除外。大学通用申请按钮不能代替当期培养项目说明。最终注册专业名称、进展评审、论文要求及 CASE 日程,应由录取与博士入学材料明确。生命科学研究学位与流程。
导师与研究条件
互补研究方向
Varsha Singh 于 2023 年以 Senior Lecturer 和 Royal Society Wolfson Fellow 身份加入 Dundee。其机构介绍把微生物气味、宿主嗅觉、GC-MS、微生物遗传学和线虫感受器研究联系起来,也涉及铜绿假单胞菌行为及呼吸道感染标志物。团队名单与近期论文反映出持续的实验研究;公开资料仍不足以推算博士完成率,也不能说明每名学生都从事电子鼻课题。Singh 团队与研究。
Didier Ndeh 研究复杂聚糖、微生物代谢及相关遗传学、酶学、化学和结构生物学。他的参与有望帮助课题把底物、代谢途径与细菌表型联系起来,但招聘没有分配具体指导工时,也没有列出专门的机器学习或传感器工程共同导师。面试时需要问清,模型验证、传感器标定和硬件接入分别由谁指导,PES 人员会怎样参与。Ndeh 实验室方向;机构论文记录。
三篇近年原创研究,以及一篇直接相关的较早工作
Pradhan 等,mBio,2025,16(7):e0114925;DOI:10.1128/mbio.01149-25,Singh 参与署名。
研究区分细菌位移与杀菌,发现竞争结果随研究背景而变。这提示微生物结果不能脱离原情境推广,未验证挥发物分类器,也不证明所有菌株间的普遍相互作用。既有阅读覆盖主文方法、结果与讨论。 mBio 原创研究。
Ndeh 等,Nature Communications,2025,16:3485;DOI:10.1038/s41467-025-58660-2,Ndeh 为主要/通讯作者。
遗传、结构及生化证据联系拟杆菌基因座与黏蛋白处理、N-乙酰半乳糖胺代谢,支持营养获取模型;所提出SusD步骤直接结合糖肽的证据仍缺失。它说明团队的代谢研究能力,没有测量挥发物或验证本岗传感器。既有阅读覆盖选定主文方法、结果与讨论。 代谢机理原创研究。
Venkatesh 等,PLOS Genetics,2023,19:e1011067;DOI:10.1371/journal.pgen.1011067,Singh 参与署名。
线虫遗传与分析证据把表皮PTR-23与FAT-7调节及热应激存活联系起来;GC-MS证据涉及脂肪酸,而非细菌顶空气体。研究体现证据相互印证及环境依赖代谢,与细菌气味分类的直接联系有限。既有阅读覆盖选定方法、结果和讨论,未复核全部补充材料。 热应激原创研究。
Prakash 等,EMBO Journal,2021;DOI:10.15252/embj.2020106938,Singh 参与署名。
这是较早的基础工作,单独列出,不充作上述2023–2025年三篇研究。化学、遗传和行为证据将细菌产生的1-十一烯与线虫嗅觉反应联系起来;线虫感受挥发物不等于人类临床诊断标志物。 气味信号基础研究。
设备与产业条件
本项目明确计划使用 GC-MS 和产业电子鼻,但没有列出传感器具体平台、菌株资源、重复设计及数据、知识产权访问规则。PES 的技术与产品资料说明其传感器业务,不能替代针对博士目标菌种的性能数据。合作方技术资料。Dundee 的共享 FingerPrints 设施证明其具备较广泛的质谱支持,但蛋白质组设备不等于已确认本课题所需的顶空 GC-MS 系统。团队论文更直接说明了相关分析经验。仪器预约、培训、维护及故障时由谁处理,仍是实际工作条件。共享分析设施。
资助、生活成本与申请
成功获奖者可获得四年学费、研究培训费用和生活津贴。2026/27津贴参考为每年21,805英镑,按 12 个月简单分摊约每月1,817英镑;2027/28 学年数额尚未确认。EASTBIO 当前 FAQ 明确,成功的国际生不收取海外学费差额;本项目资金说明也写明由 Dundee 承担该差额。这是获奖后的明确支持,不代表所有符合资格的国际生都能获奖。年度海外名额上限为 30%,各接收学校也有名额上限。CASE 导师可提名两名候选人,不等于本项目新增两个全奖。资助与学费减免;竞争规则。
奖学金不支付签证和移民医疗附加费。当前英国官方列出的学生签证申请费为 558 英镑,学生医疗附加费为每年776英镑。总额取决于签证有效期和不足整年的计算规则,不能只按四个学年简单计算。这些是当前收费,不能保证 2027 年不变;旅费、押金、家属及付款时间还须另作预算。学生签证条件与费用;医疗附加费。
Dundee 生活指南的 10,000—12,000 英镑预算针对 39 周,不能直接当作博士全年支出。它另列 2026 年第一季度一居整套住房月租 645 英镑、两居整套 839 英镑,以及 2025 年 9 月口径的不含房租生活费每月700—800英镑。以一居整套加这一生活费示例估算,总支出约每月1,345—1,445英镑;与当前津贴月均比较,约余372—472英镑,尚未扣除不资助的前期费用。这里只是情景估算,合租、实际房源与个人支出都会改变结果,博士预算还需要包括暑期。官方生活预算及口径。
保存的邓迪招生说明列2026年11月16日截止,未列钟点;当前开放状态仍须确认。现行培养计划说明链接了2027年申请表和推荐表。将完整申请表与成绩单发到 EASTBIOapplications@dundee.ac.uk,并在表中填入匿名EDI问卷的唯一回复编号;请两名推荐人将指定推荐表直接发到同一邮箱。这些当前指引已解决旧2022年表格页带来的入口疑问;本次未单独打开所链接DOCX文件的内容。现行FAQ仍规定额外CV等材料不予考虑,推荐人不能是本项目导师。统一2027年申请要求。邓迪另列研究培训费每年5000英镑、第4年降为1000英镑,属于研究和培训预算,不是额外个人生活费;所列21805英镑津贴明确为2026—27标准,并非已确认的2027金额。
申请条件与准备
课题要求相关领域、相当于荣誉学士或硕士的学历。EASTBIO 一般规则为二等一级本科或国际同等学历,不统一要求硕士;未达到这一本科等级、但有硕士或显著相关职业经验者,也可能获得个案审核。接收大学仍会审核自身的入学条件,不能只凭培养项目的一般规则判断。
Dundee 中国页面对研究学位写明,通常需要良好大学的硕士层次资格,并有科研经验,例如硕士课题。它为中国学历提供了明确路径,但中国本科直接申请者仍须确认 EASTBIO/具体课题是否允许例外。中国百分制成绩怎样换算、“良好大学”如何认定,公开资料都没有给出具体办法。中国本科学历能否达到二等一级及本岗要求,仍须由 Dundee 审核。中国申请者研究学位路径。
生命科学页面要求 IELTS 总分 6.5,阅读 5.5、听力 5.5、口语 6.0、写作 6.0,也接受其他指定英语资格。EASTBIO 允许尚未考语言时先申请,但学校可能在正式录取前要求合格证明。项目没有规定必须已掌握所有拟培训技术,也未要求机器学习论文或指定编程语言证书。研究准备可展示测量、数据质量与既有结论适用范围的判断。
既往研究的介绍应说明问题、对照、个人贡献、意外结果及验证过程。EASTBIO 面试包括一段既往研究汇报,并评估对具体项目及跨学科培养的理解。提前与 Singh 沟通有助于了解项目,但导师提名仍然需要竞争。
对在中国申请者,积极依据包括公开国际招生、成功获奖者的明确学费减免,以及大学针对中国学历的研究学位路径。之后还要完成正式录取和签证担保。学生签证要求符合许可担保机构录取、资金与英语等条件。中国未列于政府 ATAS 国籍豁免名单;本课题是否需要 ATAS,取决于研究代码及录取说明,应由 Dundee 确认,不能推定所有相关微生物学课题都需要,或所有中国申请者都会被拒。ATAS 科目与国籍规则。
职业方向与可迁移能力
相关职业能力包括培养实验、化学测量和可复现数据分析。美国劳工统计局列出的微生物职业工作包括微生物鉴定、研究、测试及科学报告,部分岗位倾向招收更高学位者。其当前 2025—2035 年增长 6% 的预测只适用于美国这一大类职业,不能用作英国或中国岗位预测、传感器市场增长率或个人薪资保证。完成这一博士也不自动取得临床检验专业执业资格。微生物职业资料。
下一步与待确认问题
这项研究将微生物实验、化学测量与真实产业传感器相连接,成功获奖后的国际学费差额也有解决安排。主要风险是海外名额有限、中国学历适用规则待确认,以及挥发物差异能否经受培养和测量条件变化。项目没有公布可推广的分类准确率或临床验证,不能只凭内部交叉验证分数判断研究是否成功。
提交前,与 Singh 讨论课题,向 Dundee 核实中国学历条件,并按已确认的 EASTBIOapplications@dundee.ac.uk 渠道递交。使用当期指定表格,并在 11 月 16 日前安排两份合格推荐、EDI 响应 ID 和成绩单。整个 EASTBIO 只能选一个项目,因此应在确定申请选择前了解导师提名安排。还应确认 2027 年 9 月与统一 10 月 1 日的入学日期差异,避免跳过生命科学预申请而直接递交通用大学申请。
面试时,确认获准范围、性能证据如何评估,以及微生物/分析/建模日常指导。生物安全监督、仪器及维护、CASE/PIPS实习、费用和产业数据权限均须商定。
接受前,取得国际学费差额减免、四年津贴与研究支持、研究预算、付款时间及不覆盖费用的书面确认。核实 ATAS、正式录取与 CAS,再按当时标准准备签证和医疗费用。与 PES 的发表、代码数据访问和知识产权如何约定,以及设备延误、写作超过资助期如何处理,也影响博士工作的可完成性。当前未查到额外家属津贴或产业加发生活费。本地提交渠道已明确;还须问清截止钟点、入学日期、中国学历适用条件和后续大学学籍申请步骤。
证据与来源
招聘于2026年10月17日采集并在当日更新,培养及开放表述是保存的历史证据,不是新核名额或个人待遇。10月25日恢复记录为HTTP 200、正文已抓取,但语义阅读与官方开放核验均未完成,不把正文当作已读。逐篇阅读范围指此前研究,未新增外查或论文主文阅读。
项目、资助与博士培养
- Official Dundee odour-detection project
- EASTBIO 2027 application guidance
- EASTBIO current eligibility, fee waiver and costs
- EASTBIO competition and 2027 timeline
- EASTBIO training structure
- Dundee Life Sciences research degree requirements
- Dundee China postgraduate research pathway
- QS World University Rankings 2027: Dundee
- Dundee REF 2021 institutional and subject results
导师、原创论文与研究条件
- Varsha Singh: research and current group
- Didier Ndeh: glycan metabolism laboratory
- Ndeh institutional publications and projects
- Pradhan et al. 2025: toroidal displacement under iron limitation
- Ndeh et al. 2025: mucin-processing genetic locus
- Venkatesh et al. 2023: PTR-23 and heat-stress lipid control
- Prakash et al. 2021: bacterial 1-undecene olfactory signalling
- PES Technologies sensing technology
- PES Technologies current product applications
- Dundee FingerPrints mass spectrometry facility
成本、国际手续与职业资料
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按研究方向和所在国家或地区整理,优先展示资助类型相近的机会。申请前请核对各项目的最新公告。
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