AI蛋白设计与冷冻电镜研究VCP/p97：索邦大学与墨尔本大学联培博士

项目概览

这是索邦大学（Sorbonne University）与墨尔本大学（University of Melbourne）联合的博士课题，研究AI设计的小蛋白结合物如何改变VCP/p97的构象动态和分子功能。法国研究环境为巴黎IMPMC-UMR 7590，墨尔本研究环境为Department of Biochemistry and Pharmacology的Bio21分子科学与生物技术研究所。招聘明确至少两年在墨尔本，第二年必须在Sorbonne停留一年。计划2027年1月1日开始，2026年11月1日截止；具体截止时刻与时区尚未说明。个人奖学金与双校协议仍需核实，不能把联合机构直接等同为单一雇主。

项目详情

VCP/p97维持细胞蛋白稳态，能提取并展开受损或不需要的蛋白，帮助后续处理与清除。其功能异常与神经退行性疾病、肌肉疾病相关；癌细胞常利用其活性应对异常蛋白负担，病毒也可能利用它参与入侵和复制等过程。这些内容是课题背景，并不意味着博士将同时开展所有疾病的治疗试验。

博士生将采用AI蛋白设计与计算工具，设计能够结合VCP/p97的定制小蛋白，并检验其对构象动态及分子功能的影响。设计出候选结构与证明其调控作用是不同环节，结合物的表达、结合和功能仍要通过实验验证。

项目以MDSPACE图像分析软件及其已有p97动态表征应用为基础，处理p97和p97—配体复合物的冷冻电镜粒子数据，描绘小蛋白参与后相关的构象状态。研究希望把连续构象变化与结合物调控联系起来，而非只获得单一静态结构。

招聘分工是：墨尔本方面负责AI蛋白设计、蛋白表达纯化、生化表征和冷冻电镜采集，Sorbonne方面负责使用新计算方法进行数据分析。双校各有研究者共同指导，但本次公开招聘正文没有直接给出正式导师任命名单，不能仅凭链接或论文作者确定导师。

计算蛋白设计、生化实验和高分辨率冷冻电镜将结合使用，帮助理解细胞必需蛋白机器怎样受调控，并为将来选择性靶向蛋白稳态通路提供研究基础；没有保证临床转化效果。

招聘提供三项研究依据：Valimehr等2023年VCP/p97机制综述，https://www.mdpi.com/2218-273X/13/5/737 ；Vuillemot等2023年MDSPACE方法论文，https://hal.science/hal-03929029 ；Valimehr等2024年p97 N端结构域构象研究，https://hal.science/hal-04519643 。综述与原创论文类型应区分，作者名单不等于导师名单。

申请要点

要求扎实的结构生物学、生物物理、计算生物学或相近学科基础。应熟悉结构生物学/冷冻电镜、计算蛋白建模设计、蛋白生化生物物理中的至少一个方向，并有开发生物信息方法和Python程序的兴趣与能力；不要求入学前掌握全部技术。

申请者必须满足两校博士入学要求。招聘以H1或等值、超过70%，或法国优秀Master 2且年级前10%说明学术水平，不能直接作为中国成绩换算公式。英语要求明确存在，具体课程的考试分数尚待确认。Melbourne官方规定：中国境内高校不适用页面所列英语授课学历豁免路径，限制涉及前学历所在机构地点，不是中国国籍禁令。

资金写明University of Melbourne scholarship，属于公共资助，但具体奖学金类别、个人金额、期限和跨国付款安排未公布。通用2027年博士奖学金标准每年A$41,100、生活津贴最多3.5年、学费减免最多4年，仅可作为制度参考，不能作为本项目个人待遇保证。双校费用、巴黎期间津贴、保险和差旅责任应写入个人录取信及IGRA/cotutelle协议。

需要进一步确认

正式Melbourne课程、Sorbonne博士学校、Home Institution、导师名单、联系和提交方式、截止时区及1月1日开始的可行性仍需确认。个人学历等值、英语、奖学金选拔及两国签证分别审批，未见中国国籍禁令不等于保证录取。还应确认跨国研究期间的显微镜、算力、数据和实验接续，以及可能超过3.5年津贴期限的生活费。既有记录保存了招聘正文，不代表本次已核验申请入口目前接受提交。

博士项目深度研究报告：以AI小蛋白结合物研究VCP/p97的构象与功能

快速判断

这个联培博士把计算蛋白设计、生化验证和冷冻电镜分析串在一起，研究小蛋白结合物能否改变VCP/p97的构象与功能。它的科学价值在于把设计结果与可验证的生物效应联系起来。适合的背景是结构生物学、生物物理或计算生物学，并在相关实验或计算方向中至少有一项实际经验。

招聘明确了索邦大学（Sorbonne University）的IMPMC-UMR 7590及墨尔本大学（University of Melbourne）联培安排，资金为University of Melbourne scholarship。计划2027年1月1日开始，2026年11月1日截止；至少在墨尔本停留两年，第二年必须在Sorbonne停留一年。截止时刻和时区、个人奖学金、正式导师名单及跨国协议仍未明确。下一步应先取得项目联系人、奖学金条款和联培协议草案，再判断这份时间表是否可执行。整体评价：研究有吸引力，行政和资金条件仍需核实。原始招聘与完整联培任务

研究要把设计得到的结合物与实际功能联系起来

VCP/p97属于AAA+ ATPase，参与提取和展开受损或不需要的蛋白，帮助后续处理与清除。神经退行性疾病、肌肉疾病、癌症及病毒感染提供了研究背景，但博士课题并未承诺同时推进这些疾病的临床开发。招聘的工作是设计能够结合p97的小蛋白，并结合生化实验与高分辨率冷冻电镜研究其作用。原始招聘与完整联培任务

几个环节都存在不确定性。计算上合理的候选蛋白可能难以表达、纯化或结合；即使成功结合，也可能不改变ATPase活性或底物处理。观察到的结构变化还可能依赖样品制备、核苷酸状态或成像所用的突变体。论文的价值取决于能否找出作用可重复、解释站得住脚的结合物，并把结构证据与功能证据联系起来。这是根据招聘工作链条作出的研究判断，不是项目保证的成果，也不是额外增加的入学门槛。

招聘把AI蛋白设计、表达纯化、生化表征和冷冻电镜采集分配给墨尔本方面，把新计算方法的数据分析分配给Sorbonne方面。两边能力互补，但设计、样品生产、成像与分析的交接也会影响进度。具体采用哪种设计模型、针对哪个结合位点、筛选多少候选物，以及仪器预约和算力配额，尚未公布。原始招聘与完整联培任务

公开任务是设计定制结合物，分析p97及p97—配体复合物的粒子数据，用MDSPACE构象图谱评估结合物的影响。申请准备或面试时，可以提出更明确的研究关口：建立不含结合物的对照，先验证表达与结合，再安排昂贵的成像；比较选定条件，并用合适的生化读数检验功能。结合特异性对照、重复样品和活性测定属于建议向团队讨论的方案，不能写成已确定的实验流程。

p97的分析难点也很具体：相对对称的六聚体核心外围有灵活的N端结构域。平均或强行施加对称性可能抹去运动，结合物又可能引入不对称。可探讨的研究方向包括比较离散分类和模型辅助的连续分析，检验初始结构与对齐的影响，并用实际图像验证选出的状态。已有论文支持这些问题值得研究，却不能保证博士一定发现新构象或发明新算法。MDSPACE作者存档与摘要、 2024年p97构象原始论文记录、 ContinuousFlex软件原始论文记录

学校、学科与培养

墨尔本官方资料显示，QS 2026生命科学与医学大类全球第14。这是有年份的宽口径学科指标，不是p97团队排名，也不能预测指导质量。Sorbonne的独立当期排名未核实。对这个课题，双方共同论文和实验、分析分工比综合名次更能说明研究匹配度。QS2026生命科学与医学学科背景

联培不是简单的海外访问。Melbourne通用规定说明毕业有两份证书，个人IGRA负责停留、指导、资金、考试和毕业安排；Sorbonne的cotutelle要求双校注册，协议明确流动、答辩、学费与知识产权。国际欢迎页进一步写明，每年在两校注册，但学费只向其中一校缴纳。岗位的“至少两年墨尔本、第二年巴黎”比通用最低停留时间更具体。正式课程、博士学校、Home Institution及个人协议仍未知。Melbourne联合博士制度与FAQ、 Sorbonne博士入学与联培注册、 Sorbonne国际cotutelle规则

就业方面，Melbourne在2022年的CCeMMP介绍把冷冻电镜培训与药企结构指导药物发现联系起来。这支持蛋白生产、结构表征、科学计算和软件开发等技能的转移价值。资料没有提供当前空缺、工资或毕业去向数据；周边培训中心研究膜蛋白，也不意味着p97本身是膜蛋白。可积累的职业资本取决于跨方法能力、可复现分析和能解释的实验结果，不能把机构合作写成就业保证。冷冻电镜产业培训环境

研究网络有直接论文依据，正式导师仍须确认

招聘链接指向墨尔本的分子机器冷冻电镜实验室及Isabelle Rouiller的大学档案。官方档案列出结构生物学、p97/VCP，以及与线粒体和神经健康相关的蛋白复合物研究。实验室使用单颗粒和断层成像，并把Sorbonne的Slavica Jonic列为合作者。这说明双方有相关研究网络，尚不能确认谁会签署本项目的导师协议、如何分工或多久见一次博士生。Rouiller官方人员档案、 Rouiller实验室

Rouiller和Jonic共同署名2023年MDSPACE论文及2024年p97构象论文，提供了具体的方法合作证据。共同署名仍不等于已被正式任命为这个岗位的导师。人员档案写Professor，未注明日期的实验室页面仍写Associate Professor；本轮没有核实晋升时间，不据此编写职业履历。MDSPACE作者存档与摘要、 Rouiller官方人员档案、 Rouiller实验室、 2024年p97构象原始论文记录

近期论文支持的是不同环节，不能合并成效果保证

MDSPACE，Vuillemot等，Journal of Molecular Biology 435(9):167951，2023年。出版商预览确认作者名单，并明确Slavica Jonic为通讯作者。方法用分子动力学引导三维到二维柔性拟合，迭代调整粒子方向、位置和连续构象图谱。实际读到的章节片段提到合成TmrAB数据测试及真实数据讨论，支持它用于异质p97图像分析。既有报告记载读取了预览、部分章节片段和元数据，没有取得完整正文或补充材料；本次编辑没有重读论文。具体性能、收敛指标和计算成本仍未核实；通讯作者身份也不能证明已被任命为新课题导师。MDSPACE出版商方法预览

p97 N端构象景观，Valimehr、Vuillemot、Kazemi、Jonic和Rouiller，IJMS 25(6):3371，2024年3月16日。既有报告记载，页面加载后补读了出版商正文中的方法、结论、数据和作者贡献。样品是p97 R155P突变体加ATPγS，使用200 kV Talos Arctica与K2探测器，论文报告2,359部电影；常规重构在C1和C6下分别达到3.9 Å与3.5 Å。MDSPACE从野生型5FTK模型出发，使用最低频的五个简正模式，以Cα Gō模型做50 ps、50 K的短拟合，首轮使用5,000个粒子。值得关注的是，32,510次失败拟合被剔除，UMAP聚类由人工挑选，再把单体坐标放回六聚体解释。这些筛选步骤提示未来结合物数据应做稳健性检验。正文不同段落分别写274,640和272,640个粒子，本报告保留差异，不自行修正。小于2%的少见状态和最多60度运动是特定样品条件下的观察，不能变成普遍检测保证或生理功能证据。贡献声明把概念设计列给Rouiller与Jonic，软件列给Vuillemot与Jonic，指导列给Rouiller、Kazemi和Valimehr，未将Jonic列为这篇研究的指导者。论文角色仍不能证明新博士的任命；完整验证及补充材料未读。p97出版商方法与贡献声明

MDSPACE、MDTOMO与ContinuousFlex软件，Vuillemot、Harastani、Hamitouche和Jonic，IJMS 25(1):20。在线发表为2023年12月19日，卷期通常按2024年引用。既有报告记载补读了出版商的结果、讨论、方法、作者贡献和数据段落。流程依赖已有原子模型、预处理和对齐的粒子或亚断层数据，经拓扑生成、能量最小化和简正模式分子动力学做柔性拟合；分析轨迹时先去除拟合引入的刚体运动，再用PCA、UMAP及人工或k-means分组重构。约束过强可能过拟合图像噪声并扭曲模型，MDSPACE与MDTOMO的3,000和1,000默认值只是软件设置，不是所有体系的最优值。作者建议先在少量粒子上检查相关性、RMSD和能量，温度、步数及计算成本随模型变化。贡献声明把软件列给Vuillemot、Harastani和Hamitouche，验证列给Vuillemot与Jonic，指导、资源、资金及项目管理列给Jonic。文章借用此前的方法验证，没有提供第三份独立生物学证明；代码、教程和补充材料未实际运行或完整阅读。ContinuousFlex出版商方法与贡献声明

三篇原创论文分别支持方法、应用和软件，不能合并为三次证明AI设计的p97结合物有效。招聘引用的2023年Biomolecules文章是综述，没有计入原创论文数量。继承的阅读记录是一篇出版商预览及两篇出版商 HTML 的实质章节，不声称本次完整阅读三篇正文或新增补充材料核读。图像中的状态比例仍不能自动当作生理自由能或功能变化的因果证据。

Bio21公开介绍了跨学科分子生命科学、设备平台和产业合作环境。实验室及论文机构信息进一步支持相关成像和研究网络，但不能保证博士生获得多少显微镜时段、样品支持或GPU额度。巴黎期间的实验接续、跨国数据传输和排期，应在面试中具体讨论。Bio21研究环境、 Rouiller实验室、 2024年p97构象原始论文记录

个人奖学金必须与通用标准分开确认

招聘写University of Melbourne scholarship，资金类别为公共资助，但没有明确属于Melbourne Research Scholarship、RTP还是另一种联培安排。它也未证明有法国博士雇佣合同或企业工资。个人金额、税务、学费分配和期限，以录取信与IGRA为准。原始招聘与完整联培任务

保存的 Graduate Research Scholarships 通用页面给出2027年全日制每年A$41,100，博士生活津贴最多3.5年、学费减免最多4年，另列符合条件的海外搬迁支持和国际学生单人OSHC。条款说明具体权益和金额由个人录取信确定，已有博士学习时间可能减少剩余资助。含津贴和学费的奖学金按成绩与科研潜力竞争选拔；符合录取要求不等于获得生活津贴。因此A$41,100只是参考标准，不是本人的确定待遇。2027通用博士奖学金、 博士奖学金正式条款

联培通用规则通常允许主校津贴在海外研究期间继续发放，同时说明部分协议按实际地点由双方分担。最长注册学制为4年，通常津贴最多3.5年；如果用满学制，可能出现末段生活费缺口，但这不证明本项目已存在资金缺口。通用规则提到流动费用支持，另一国的保险则应另行核实。巴黎期间如何付款以及是否承担汇率波动，不能自行假定。Melbourne联合博士制度与FAQ、 博士奖学金正式条款

按A$41,100除以12计算，月度参考额为A$3,425。墨尔本官方生活费指南列出的市区一居室整套公寓周租中位数为A$475，乘以52周为A$24,700；每年余下A$16,400支付饮食、水电、交通等。这只是把两项通用数据放在一起的透明示例，不是税后工资测算或个人租房报价。指南返回的正文没有写明租金观察年份，整套房租也不能直接作为合租者个人房租。巴黎预算尚未独立量化，本报告不提供未经核实的汇率换算。2027通用博士奖学金、 Melbourne官方生活费指南

Sorbonne在2026年7月更新的费用页列出2026/27博士标准注册费€398，博士生不适用非欧盟差异化学费。联培候选者实际向哪校缴费、是否减免，仍由协议决定；不能直接认定个人一定支付€398。CVEC属于另一项手续，个人适用性及金额未核实，也不能把非欧盟硕士学费套在博士身上。Sorbonne2026/27费用、 Sorbonne博士入学与联培注册、 Sorbonne国际cotutelle规则

申请条件包括双校审批和英语，不能自行换算成绩

招聘要求结构生物学、生物物理、计算生物学或相近方向的扎实基础。现有技术经验至少覆盖结构生物学/冷冻电镜、计算蛋白建模设计、蛋白生化生物物理中的一个方向，并要求具备开发生物信息方法和Python程序的兴趣与能力。并未要求入学前掌握全部技术。只有泛泛AI兴趣、缺少生物或物理推理证据的背景，需要补足具体项目经历；纯实验背景也应说明如何学习定量分析。原始招聘与完整联培任务

两校条件同时适用。招聘写H1或等值，并以超过70%、法国优秀Master 2且前10%说明等值水平，不能据此直接换算中国成绩。Melbourne会逐项评估外国学历及科研准备，Sorbonne则需要Master或等值、导师与研究单位同意、博士学校提名和最终校级批准。正式课程及博士学校的判断不可省略。原始招聘与完整联培任务、 国际博士入学要求、 Sorbonne博士入学与联培注册

英语是中国申请者需要尽早处理的条件。Melbourne官方政策明确：中国境内高校不适用页面所列的英语授课学历豁免路径。限制针对前学历所在机构的地点，不是中国国籍；中国公民持符合条件的海外学历是另一种情形。考试分数取决于正式课程，页面中的IELTS 6.5例子只是某种前学历路径的条件，不能当成本岗位确定分数。学校允许先申请后考试，但满足英语要求前不会完成最终录取。Melbourne研究生英语条件

招聘及包含国际学生的通用奖学金资格中，未观察到明确中国国籍禁令。这说明存在可以核实的申请路径，仍取决于个人学历、英语、竞争选拔和移民审批，不等于保证录取或资助。澳大利亚期间需要学生签证、CoE及OSHC，法国期间另有签证和保险条件；本轮未核实任何特定国籍的签证结果。2027通用博士奖学金、 国际博士入学要求

建议准备一份简短、能举证的研究材料：说明过去一个结构、实验或计算结果；复现一个公开连续分析小流程；指出初始模型可能怎样影响解释；并提出如何检验结合是否改变功能。根据Melbourne通用联培指导，CV、成绩单和针对课题的研究说明可以用于初次联系；本项目的完整提交清单和实际入口仍须确认。Melbourne联合博士制度与FAQ、 ContinuousFlex软件原始论文记录

下一步先解决录取与跨国资金，再讨论实验细节

申请前，确认ABG140431仍有有效提交渠道，取得正式联系人、Melbourne课程及Sorbonne博士学校名称；核实课程级成绩等值、英语分数、材料和截止时区。还要确认从11月1日截止到2027年1月1日开始，是否能完成双校录取、IGRA和签证。

面试时，讨论各阶段指导分工、怎样测定生物活性、用什么对照排除样品或分析伪影，以及巴黎期间的显微镜、算力和数据权限。会面频率、代码与数据产权、发表要求，以及表达或结合失败的备选路线，都需要具体答案。

接受前，以个人奖学金和IGRA确认金额、期限及税务，法国一年怎样支付，双校学费、CVEC、保险、差旅由谁承担，以及学制末段和旅行或指导安排变化时的处理方式。这些条款决定研究机会能否真正执行。

证据与来源

既有报告日期为 2026 年 10 月 12 日，记有 10 月 7 日招聘发布与 10 月 8 日历史采集记录创建日期，两者均不是申请截止。原 21 项一手资料及三项后加载出版商页面的数量保留为研究历史，不代表本次新增核验。本次复用保存的双语报告和认证记录，没有外网核验或论文重读，未重新确认当前页面、提交入口或政策更新。各论文原有阅读范围仍逐项保留，未补写缺失署名。

招聘、入学和资助

• 原始招聘与完整联培任务
• Melbourne联合博士制度与FAQ
• 2027通用博士奖学金
• 国际博士入学要求
• 博士奖学金正式条款
• Sorbonne2026/27费用
• Melbourne研究生英语条件
• Sorbonne博士入学与联培注册
• Sorbonne国际cotutelle规则

研究机构与论文

• Bio21研究环境
• MDSPACE作者存档与摘要
• Rouiller官方人员档案
• Rouiller实验室
• 2024年p97构象原始论文记录
• ContinuousFlex软件原始论文记录
• QS2026生命科学与医学学科背景

生活成本与职业背景

• 冷冻电镜产业培训环境

• Melbourne官方生活费指南

• MDSPACE出版商预览

• p97出版商方法与贡献

• ContinuousFlex出版商工作流与贡献