EDCS博士项目：AI引导的合成蛋白靶向降解设计

【项目简介】 靶向蛋白降解（TPD）已成为一种强有力的治疗策略，用于消除那些难以通过传统小分子药物抑制的致病蛋白。PROTACs和LYTACs等技术已展示了利用细胞的泛素-蛋白酶体和溶酶体系统选择性降解特定蛋白的潜力。然而，由于缺乏合适的结合配体，许多蛋白质仍然是“不可成药”的。人工智能和蛋白质工程的进展为设计能够选择性识别和降解这些挑战性靶点的合成蛋白提供了新机遇。

【研究内容】 本博士项目将依托A. Wood和D'Angiolella实验室在靶向蛋白降解和泛素生物学方面的专业优势，并由生物与工程学院合成蛋白设计专家Chris Wood博士共同指导。计算蛋白质建模领域的最新突破，包括AlphaFold等系统以及ProteinMPNN和RFdiffusion等生成式蛋白质设计方法，使得能够合理设计具有高特异性和稳定性的新型蛋白结合物。这些工具在C. Wood研究组中已常规使用，将用于生成通过招募E3连接酶或溶酶体来降解靶点的双功能蛋白。为最大化该技术平台在本地的应用价值，靶蛋白将根据IGC及其他爱丁堡研究人员的疾病研究领域优先级确定；具体包括胆管癌（合作者：Boulter）、结直肠癌（合作者：Myant）和胶质母细胞瘤（合作者：Pollard），以促进在尖端疾病模型中的靶点验证。

【项目意义】 通过将机器学习与合成生物学和结构生物信息学相结合，本项目旨在扩展靶向蛋白降解的工具库，超越小分子的局限。由此产生的AI驱动设计框架可加速下一代生物降解剂的研发，并为针对目前难以治疗的疾病靶点开辟新的治疗干预途径。该项目将连接IGC的多个研究主题，同时为学生提供高度相关的技能组合，以从事学术界或工业界的职业发展。

【资助信息】 爱丁堡博士学院奖学金涵盖大学学费以及按UKRI标准发放的4年生活津贴（但不包括耗材费用），面向所有申请者开放。

【申请方式】 申请请按照以下链接中的说明进行： EDCS奖学金 | IGC研究生研究与培训 | 遗传学与癌症研究所