脊椎动物启动子多样性研究

【项目介绍】

基因调控过程对于确保基因在正确的时间和地点正确表达至关重要。然而，尽管其在人类健康中具有明确作用，调控元件（通常位于蛋白质编码区域之外）在历史上一直相对缺乏研究，因此识别其中的致病性变异仍然是一项挑战（PMID:40229884）。

启动子是DNA序列，对转录起始至关重要。根据内容可大致分为两类（CpG岛启动子和TATA框启动子），它们包含招募基础转录机制的关键元件，并调节基因转录方式。我们最近发现一种新的表观遗传标记——组蛋白H3第115位赖氨酸乙酰化，有助于核小体失稳，并代表重要调控元件的潜在生物标志物。该标记仅存在于CpG岛启动子，而不存在于TATA框启动子中（PMID: 41778583）。

因此令人困惑的是，与同源基因相关的启动子类型（CpG与TATA）在不同物种之间可能存在显著差异。这引发了关于启动子进化历史、其组成元件以及是否存在替代机制使这些基因能够缓冲转录噪声的问题。

本项目将利用大规模多物种数据，绘制脊椎动物人类同源基因的启动子多样性图谱。您将开发新的生物信息学策略，并使用最先进的比较基因组学方法来探索启动子进化，识别参与其多样性的关键元件，并为其对基因调控的贡献提供重要见解。

通过这项工作，我们将能够精确定位物种内部和物种之间的关键启动子元件，并识别对启动子组成变化耐受性较高或较低的基因。这将为提高我们检测这些重要非编码元件中致病性变异的能力提供基础知识，并为围绕启动子作为新型治疗靶点的讨论提供信息。

【申请要求】

申请请按照以下页面的说明进行： EDCS奖学金 | IGC研究生研究与培训 | 遗传学与癌症研究所

【资助信息】

爱丁堡博士学院奖学金涵盖大学学费以及按UKRI标准发放的4年生活津贴（但不包括耗材费用），并向所有候选人开放。