年龄相关黄斑变性视网膜数字孪生博士项目

项目1495 · CNRS · Unité de biologie moléculaire, cellulaire et du développement

所在国家或地区: 法国
申请截止日期: 2026-11-10（具体时刻请核对原始公告）
资助信息: MSCA PANDORA博士网络支持；全职35小时，个人薪资、资助期限与具体覆盖尚未列明。

申请工作台

保存项目，围绕当前机会准备申请。截止日期和资格请以原始公告为准。

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项目介绍

项目概览

图卢兹CBI招收1名计算系统生物学／生物信息博士，研究年龄相关黄斑变性（AMD）视网膜的多尺度预测数字孪生，网络岗位DC8。

课题属于MSCA PANDORA博士网络，由Anna NIARAKIS教授指导，连接分子互作图、Boolean模型、组学和agent-based模型。

拟2027年2月1日开始，每周35小时、全职固定期限。采集记录列2026年11月10日00:00 UTC截止，原报告读取的CNRS页未印时区，应确认并在前一晚前提交。

保存的CNRS正式招聘列36个月合同、税前月薪€3,630.25；优秀英语为要求。基础法语出现在早前采集记录，但原报告读取的CNRS正式页未列，应向招聘方确认，不能直接当作已核实硬门槛。CNRS正式岗位。

项目详情

CBI位于法国Toulouse，由CNRS与图卢兹大学共同设立，研究不同尺度的整合生物学。学生加入Systems Biology组，研究AMD病理机制及新药优化。介绍将AMD称为老年人失明的最常见原因，并指出机制复杂且未完全理解，因此以系统建模整合多类数据，研究单一实验难以直接解释的机制。

计算建模把多种生物学信息放进统一框架，可先在计算机中测试扰动，预测病理机制及对治疗的响应，再交由实验测试。数据整合、扰动计算和实验比较构成研究流程；模拟用于提出和筛选假设，而不是替代实验验证。

计算工作先建立与AMD及补体系统有关的大规模视网膜分子互作图，再使用CNRS／UPS及INRIA开发的map-to-model框架，将互作图转为可执行Boolean逻辑模型。联盟生成的组学数据用于让模型适应AMD特定条件。分子图、模型和数据之间需要逐步衔接，不能把绘图本身等同已经完成预测。

随后把逻辑模型整合到多尺度agent-based model（ABM），模拟细胞间通信和组织稳态，构建病变视网膜数字孪生。任务既关注分子机制，也关注细胞与组织，介绍没有指定一个固定商业软件、编程库或现成视网膜数据集，因此不应自行补写确定工具栈。

模型将模拟网络实验所研究的扰动，包括环境应激、不同细胞外基质组成、基因失活及功能获得变体。计算预测要与PANDORA伙伴提供的体外数据比较；预测与验证是两个步骤，病理和治疗效果不能仅由模拟结果视为已证实。

最后，模型用于治疗再定位策略，识别并排序AMD潜在新治疗靶点，交由联盟开展实验验证。这是预期研究产出，不是已确认有效的候选药物或临床疗法。博士需理解病理机制与生物医学转化，同时能解释模型如何从数据产生可以测试的假设。

实验室近期开发的技术可把Boolean模型扩展至最多1,000种生物分子，ABM扩展至数千agent。学生将在此基础上构建大尺度预测模型。该规模描述是团队方法基础，不代表所有视网膜生物过程都已纳入，也未给具体算力配置、数据权限及学生承担的模型规模。

招聘重视求知欲与动机，要求扎实计算／系统生物或生信及相关定量基础、细胞和分子生物知识。Python、R或相似编程经验，网络生物学、数学建模和／或组学分析均相关。逻辑／Boolean、ABM、分子图经历为重要加分；补体、眼生物学或治疗再定位训练也加分，而非必须同时具备所有专项经历。

申请要点

学历：生信、计算／系统生物、定量生物、计算机、应用数学或相近硕士／等效；化学、物理、生物资格分类均列硕士。
能力：优秀英语写作口语及报告表达，独立工作、跨学科合作和病理转化研究兴趣；愿赴伙伴单位外派。
语言：正文强调优秀英语，早前采集资格另列基础法语；原报告保存的CNRS正式页未列法语，应核对工作语言、法语适用环节及可接受英语证明。
经验：申请资格未要求既往研究年数，专项模型或生物训练为优势，不能自行改成多年经验硬条件。
时间：2026年10月10日发布，2026年11月10日00:00 UTC截止，该时刻是当日开始，不应写成当天深夜。
申请：https://emploi.cnrs.fr/Offres/Doctorant/UMR5077-MARPEL1-027/Default.aspx；CBI网站http://www.cbi-toulouse.fr/。
指导：Anna NIARAKIS教授；现有资料无完整个人咨询邮箱或材料清单。

需要进一步确认

需核对CNRS最终合同、博士注册学位路径、税后工资与适用津贴、网络个人资格和外派要求。MSCA一般要求招聘时未取得博士学位，招聘前36个月在法国居住或从事主要活动不超过12个月；国籍原则开放不等于个人资格或居留自动获批。还需确认组学及体外数据交付、模型验证范围、算力与数据使用、Boolean与ABM工作分工、合作导师和发表安排。MSCA网络身份不等于每项个人资格已核定；不得据税前金额保证个人净收入或生活结余。

查看收录来源与申请要求

收录来源可能是学校或招聘平台；正式申请入口及最新要求请核对公告与下方报告中的官方来源。

项目深度调研报告

报告生成记录：2026-10-11。生成日期不代表招聘方确认项目仍开放。

资料更新记录：2026-10-28。申请前请再次核对原始公告。

CNRS博士：AMD视网膜多尺度数字孪生（PANDORA DC8）

申请判断

分子变化怎样影响AMD视网膜的细胞通信与组织状态，计算预测又如何接受独立实验检验？PANDORA DC8连接分子相互作用图、布尔模型、联盟组学资料和基于主体的模型，研究年龄相关性黄斑变性（AMD）的多尺度机制。它适合有扎实系统生物学或生物信息建模经历的申请者。MSCA网络提供科研与资助背景，个人流动资格、法国居留、博士注册及税后收入仍需逐项确认。PANDORA CORDIS fact sheet MSCA Doctoral Networks guidance

保存的CNRS正式岗位列图卢兹36个月全职博士合同（每周35小时）、2027年2月1日入职、税前月薪 3,630.25 EUR。截止为 2026年11月10日00:00：采集记录标UTC，CNRS页面本身未印时区。应先确认并在前一晚之前提交，不能将11月10日当作仍有完整一天可申请。CNRS job offer

英语为明确要求。基础法语出现在早前采集元数据中，原报告读取的CNRS正式页未显示，应确认它是否适用于入职、实验室交流或博士注册，不将其直接写成独立核实的硬门槛。CNRS job offer

研究问题与博士工作

尚未解决的问题

课题通过计算模型研究AMD、补体系统及治疗优化。CNRS说明将AMD描述为病理机制尚未充分理解的复杂疾病，适合用系统层面的模型研究。博士将构建AMD及补体相关的大型视网膜分子相互作用图，用map-to-model框架转成可执行布尔模型，结合联盟组学资料赋予具体生物学情境，再嵌入基于主体的模型（ABM），模拟细胞间通信及组织稳态。其核心是机制与多尺度建模，不能只理解为一般眼科数据分析。CNRS job offer

转化目标是把计算预测与PANDORA合作方的体外数据比较，利用模型优先筛选新的治疗靶点，再进行实验验证。这适合希望以建模提出可检验生物医学假说的申请者。风险在于数据交付、合作方时间表及验证流程尚未完整公开，应问清36个月合同内能获得哪些组学数据、体外模型和AMD扰动实验。CNRS job offer

工作方法与潜在产出

可能产出包括经过整理的AMD／补体分子相互作用图、可执行布尔模型、结合组学的模型变体、用于细胞与组织相互作用的ABM层，以及治疗重新定位的候选假说。官方说明称，实验室近期技术可把布尔模型扩展到1,000个生物分子，ABM可达数千个主体。这体现团队平台能力，但不保证博士模型会纳入所有视网膜细胞类型或AMD机制。CNRS job offer

PANDORA的CORDIS资料显示，网络研究补体介导AMD病理机制、治疗开发、组学、成像、模型系统、生物标志物及药物发现，与DC8计算整合和靶点优先排序任务相吻合。PANDORA CORDIS fact sheet

学校、学科与培养

CNRS作为科研雇主具有较强背景。官方介绍将其定位为覆盖各学科的主要基础研究机构，拥有较大的预算、人员及实验室网络。博士判断更应关注CNRS／图卢兹大学／CBI研究环境和MSCA网络联系，而不只以大学排名评价。CNRS profile CBI Toulouse

博士注册路径尚需确认。CNRS岗位说明CBI为CNRS与图卢兹大学联合单位；图卢兹博士页面要求首次注册经博士学院批准、提交完整材料、缴费及行政确认。2026-27博士注册费为398 EUR，但本岗位实际注册学校和博士学院应向导师或HR核实，不能认定雇佣完成便自动取得博士学籍。University of Toulouse doctoral registration Science PhD enrolment

领域背景较积极。法国有数字健康创新战略，OECD的医疗AI讨论涉及生命科学创新、计算生物学和药物开发。本项目结合疾病模型、生物信息、数字孪生、组学及药物再利用，与这些方向相连，但直接学术领域仍较专门。France 2030 digital health strategy OECD AI in healthcare

导师与研究条件

导师研究方向

导师为Professor Anna Niarakis。CBI官方介绍显示，她是计算系统生物学教授，研究复杂人类疾病、疾病图谱、模型推断工具、网络整合、动力学模型及免疫数字孪生。她主持的CoSysBio研究复杂人类病理的数字孪生与计算模型，涉及组学、数据整合和预测建模，与AMD数字孪生课题紧密相关。Anna Niarakis CBI profile Computational Systems Biology Hub

CBI为CNRS与图卢兹大学共同建设的整合生物学中心，公开介绍超过400名人员，设有研究团队、平台及支持服务。计算与系统生物学方向推动生物、物理、计算机科学、统计和数学之间的定量建模，为跨学科研究提供基础。CBI Toulouse CBI Computational and Systems Biology axis

近期重要论文

以下沿用原报告的三篇论文概述。现有文本没有记录完整有序署名、Niarakis作者位置及各篇具体阅读级别，本次不补造，也不声称完成全文评估。类风湿关节炎和免疫系统模型是方法参考，不能作为AMD视网膜模型的验证。Niarakis参与的2023年npj Systems Biology and Applications论文，为类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞建立大型布尔模型，进行药物协同和再利用预测。这与本课题可执行疾病图谱及靶点排序的方法直接相关，疾病对象则不同。Boolean model drug-synergy paper

2024年同刊免疫数字孪生论文讨论应用、局限及实施难点。AMD／补体建模也会遇到多尺度生物表示、模型可信度、数据整合，以及计算孪生与经过实验验证的干预之间的距离，因此该论文具有方法参考价值。Immune digital twins paper

2024年npj Digital Medicine论文提出模块化、多细胞滑膜关节虚拟孪生，体现团队从单个网络模型转向多细胞虚拟孪生架构的进展，可为布尔模型与基于主体的多尺度模型整合提供前期研究参考。Virtual twin paper

资助、申请与生活成本

本岗位待遇高于法国一般博士最低薪资背景。保存的CNRS页面列36个月、3,630.25 EUR税前月薪，另有44天年假／RTT、远程工作安排及补偿、75%公共交通报销和最高300 EUR可持续交通津贴。CNRS一般博士合同薪资背景更低，因此本岗位待遇应以具体官方招聘为依据。个别津贴的适用条件仍须合同确认。CNRS job offer CNRS compensation page

中国申请者的国籍路径总体开放，但资格不是自动满足。MSCA Doctoral Networks一般允许各国籍博士候选人申请，招聘时须没有博士学位，并满足流动规则：招聘前36个月中，在法国居住或从事主要活动不超过12个月。在中国或其他国家居住的中国公民通常不存在国籍本身的障碍，但近期在法国学习或工作的时间需要仔细核算。MSCA Doctoral Networks guidance MSCA Doctoral Networks 2026 guide

有工资与合适接待协议时，法国居留手续具备可办理基础，仍需走正式流程。法国博士指引及Campus France介绍，外国博士／研究人员具备资金或劳动合同、接待协议后，可了解researcher-talent路径。Service-Public也要求经认可机构签署接待协议。此处不能解读为签证或居留自动批准。Research hosting agreement Campus France researcher-talent visa Service-Public talent card

这份工资可作为生活预算的基础，仍需按个人情况计算税后收入和租房成本。Campus France的一般学生预算为食物、交通和住房合计600-800 EUR／月；图卢兹住房资料及Crous价格提供较低价选择，但受房源限制。一般学生预算不能直接用作博士雇员的个人预算；实际税后收入、社保扣款、适用家庭津贴、搬迁及首月押金仍应依据CNRS合同核对。Campus France cost of life Campus France Toulouse housing guide Crous Toulouse rent tariffs

申请背景与准备

背景与技能要求

更匹配的背景为生物信息、计算生物、系统生物、定量生物、计算机科学、应用数学或相关硕士层次，具有Python、R或类似编程证据。申请宜展示网络生物学、数学建模和／或组学数据分析，以及足够的细胞及分子生物学基础，以理解AMD与补体问题。CNRS job offer

保存的CNRS岗位要求英语口语与写作优秀，并具备展示能力。逻辑／布尔模型、基于主体建模、分子相互作用图、补体、眼部生物学及治疗重新定位经验是优势。基础法语仅在早前采集信息中出现，原报告保存的CNRS官方页面未列，应询问HR入职、实验室交流或博士注册是否需要法语。CNRS job offer

建议准备

较有价值的准备是一份简短而具体的建模作品：布尔／逻辑模型、组学或网络分析实例、可复现Python／R流程，并说明预测如何已被验证或可接受实验验证。湿实验较强但编程较弱者，应认真评估计算任务；计算机背景强而缺少细胞分子生物学者，可补充学习补体、视网膜疾病或疾病图谱整理的证据。Computational Systems Biology Hub Boolean model drug-synergy paper

下一步与待确认问题

申请前先确认截止时区。“2026年11月10日00:00”是当日开始时的时间，采集记录使用UTC。宜在11月9日UTC晚间之前完成，避免误把10日当作完整申请日。同时确认基础法语是否仍适用，原报告保存的官方页仅列英语。CNRS job offer

面试可问第一年有哪些PANDORA数据、合作方何时提供体外验证数据、借调出行量，以及具体图卢兹博士学院注册安排。还需问清ABM与布尔模型层在学生、导师、INRIA／CNRS合作者及联盟伙伴间如何分工。

接受聘用前核对完整合同：税前到税后、MSCA津贴、适用家庭津贴、社保扣款、签证与接待协议时程、博士注册费由谁承担、搬迁时间、发表审阅和数据共享限制。这些属于执行风险，需要落实后判断。

证据与来源

本次只编辑保存的招聘和报告，没有新增名额核验或论文阅读。原报告称当时CNRS页面开放，不代表本轮重新确认名额；三篇论文保留原有概述，未记录的完整署名、个人分工及阅读级别仍未知，不升级为全文评估。

关键证据涵盖CNRS岗位、机构和实验室、PANDORA与MSCA规则、近期论文及生活成本资料。以下保留英文报告引用；其后分组列出研究记录的来源。

岗位、培养与资助

机构、领域与生活资料

导师、论文与研究条件

按研究方向和所在国家或地区整理，优先展示资助类型相近的机会。申请前请核对各项目的最新公告。

INSERM · 法国

癌症疫苗相关抗原—RNA复合物与免疫耐受博士

ANR通过France2030的IHU RespirERA（ANR-23-IHU-0007）提供三年全职博士合同，预计2027年1月开始；未给具体工资、学费和个人补贴金额。

2026-11-15（具体时刻请核对原始公告）

Sorbonne Université · 法国

PANDORA DC4 博士：补体失调与黄斑变性免疫机制

MSCA 资助的 36 个月全职合同，约 €2,800／月税前工资，未扣税及员工社保；另有流动津贴，符合条件时有家庭津贴。具体津贴金额和净收入未公布。

2026-11-30（具体时刻请核对原始公告）

University of Oldenburg · 德国

奥尔登堡大学博士：医疗系统应用密码学与隐私可信AI

100% E13 TV-L雇佣，可协商非全日制；尽快入职，固定至2030年9月30日。含年度特别支付、职业养老金和30天年假。2026年4–12月E13第1档税前€4,759.37/月仅作日期参照，个人档次、净薪及注册／搬迁费用另核。

2026-11-08（具体时刻请核对原始公告）

UNIVERSIDAD POLITECNICA DE MADRID · 西班牙

SONIFY有薪博士：声光测量与复杂声场重建

税前年薪€28,000，每周37.5小时，预计2026年11月开始、工作48个月；法律形式为不定期科学技术活动合同，不能推定48个月后继续资助。含会议差旅及较长期海外研究访问经费；个人学费、注册及搬迁覆盖须确认。

滚动申请，当前是否仍招请核对原始公告。

Radboud University · 荷兰

树突多突触可塑性有薪博士

P档全职税前月薪3204—4051欧元，8%假期和8.3%年终；初始1.5年，正面评价后全职累计4年或0.8FTE累计5年。